HPE以領先科技助力加拿大著名學府——麥克馬斯特大學（McMaster University）的研究實驗室收集並分析海量基因組數據，加速發現病原體的變異和傳播方式。
生死時速，分秒必爭。
與時間賽跑往往是醫療工作者的日常，不止是處於一線的醫護人員，實驗室中的醫學研究人員也希望在儘可能短的時間內了解病因病理，進而快速開發出最有效的治療手段與藥物。這一過程涉及到大量的實驗，只有快速處理和分析數據並挖掘洞見才能「數」戰速決，加速研究。因此，可靠且性能強大的基礎設施至關重要。
HPE近日宣布，麥克馬斯特大學的McArthur實驗室開發出了一套能夠以最快速度準確發現新冠病毒變異體的軟體包，HPE Superdome Flex在其中發揮關鍵作用。該實驗室利用HPE Superdome Flex快速匯集並處理原始基因組數據，提取洞見，幫助全世界有效預防病毒變異。HPE為麥克馬斯特大學提供的解決方案在應對疫情上發揮出了明顯的效用，它不僅幫助研究人員監控病毒變異，而且能夠協助調查新冠病毒感染情況，將收集和分析陽性病例數據的時間從原來的9至10個小時縮短到不足1小時。
在研究人員著手對原始基因組數據進行排序的同時，McArthur實驗室也與Sunnybrook衛生科學中心（Sunnybrook Health Sciences Center）的病毒學家共同研究是哪些病毒導致了患者感染，以及病原體是如何形成新的變異並在人群中傳播的。這兩個團隊在疫情之初就投入了研究工作，是加拿大最早（2020年1月）分離出SARS-CoV-2病毒並進行研究的團隊。他們也將這些信息與衛生管理部門和醫藥公司共享，幫助他們研發疫苗和治療藥物。
麥克馬斯特大學生化及生物醫藥科學系教授Andrew McArthur博士，同時也是M.G. DeGroote傳染病研究所 (IIDR)和加拿大流行病及生物威脅全球關係組織（ Canada's Global Nexus of Pandemics and Biological Threats）的成員之一，他表示：「與其它的傳染病實驗室一樣，我們需要了解疫情初期病毒的傳播情況。在科學家開始對SARS-CoV-2基因組進行排序的前兩周里，我們就重新設計了整個管道，並且搭建了一個平台，準備收集病毒的基因。在基因組裝的過程中，你需要有1000倍的冗餘才能確定一個患者底是被什麼病毒感染。當被研究的感染者的數量達到100位時，我們收集到的數據將高達幾個TB。但疫情不容耽擱，我們必須在一個小時內就得出結果。因此，我們選擇了HPE解決方案來大幅縮短收集和分析數據的時間，從而加速對感染者的病毒基因學研究並得出結果。」
除了HPE Superdome Flex伺服器之外，HPE還提供世界上擴展能力最強的模塊化內存計算能力，McArthur實驗室還採購了HPE的其它解決方案，包括：
- HPE Nimble Storage HF20C：用於存儲基因排序團隊的海量基因組原始數據。
- HPE Apollo 6500系統：特別適合在開發AI算法時運行深度學習工作負載，能夠基於細菌基因組排序預見抗生素失效問題，也可以部署機器學習，助力新藥研發。
HPE執行副總裁兼高性能計算及AI業務總經理Justin Hotard表示，「在基因組學中，科技在DNA研究中發揮著關鍵作用。研究人員藉助高性能計算能力可以大規模處理數據，從而預測、診斷和治療各種疾病。McMaster實驗室的研究對公眾來說意義重大，其藉助HPE Superdome Flex強大的計算能力，可以實時分析海量數據集，並快速解決疫情醫學研究過程中的關鍵問題。」