前文介紹了地球聯合軍的宇宙艦船，今天給大家介紹一下地球聯合軍的對手ZAFT/扎夫特的艦船。扎夫特在CE宇宙里最早運用MS的軍隊，其艦船一般都是圍繞MS的運用和部署進行建造的。
蘿拉西級
蘿拉西級是扎夫特的標準型宇宙戰艦，裝備了一系列光束炮和電磁炮，因此，蘿拉西級比大部分聯合軍戰艦更重型。本艦也配有內部格納庫，可停靠6台MS。該格納庫在艦船的較低區域，可以分離並作為大氣圈突入膠囊。儘管引入了更快和更有力的納斯卡級，蘿拉西級仍然是扎夫特的主要戰艦。
中文譯名：蘿拉西級
製造方：扎夫特
所屬方：扎夫特，巨蛇之尾
尺寸：未知
重量：未知
最大搭載數：6部機動戰士
裝備和設計特點：無
固定武器：937mm二重高能量光束炮×2；450mm雙重電磁炮；450mm電磁炮×2；58mmCIWS×6；125mm加農炮×2；450mm多用途直線發射系統×4
已確認艦隻:
卡莫夫號[ガモフ]
ZAFT軍克魯澤隊所屬，分類為羅拉西亞級MS搭載艦，艦長為塞爾曼。在與地球聯合軍第八艦隊會戰時，和第八艦隊旗艦墨涅拉奧斯號同歸於盡。本艦的名稱來源於二十世紀宇宙物理學家卡莫夫。
伽伐尼號[カルバーニ]
ZAFT軍所屬，分類為羅拉西亞級MS搭載艦，艦長為克魯澤。本艦是克魯澤在受領威薩利烏斯號之前所乘的艦隻，曾參加了C.E.70年6月2日的恩底彌翁攻防戰並與聯合軍第3艦隊交戰，在友軍部隊遭受「獨眼巨人」系統攻擊後撤退。本艦的名稱來源於十八世紀發現動物電的義大利解剖學和醫學教授伽伐尼。
齊格勒號[ツィーグラー]
與ZAFT軍克魯澤隊一起追擊大天使號的羅拉西亞級MS搭載艦，也是卡莫夫號的同型艦。本艦的名稱來源於以低壓法製造聚乙烯而獲得諾貝爾獎的化學家齊格勒。
馬爾比基號[マルピーギ]
在月面恩底彌翁環形山與地球聯合軍第3艦隊交戰的羅拉西亞級MS搭載艦，在聯合軍使用「獨眼巨人」之後撤退。本艦的名稱來源於十七世紀義大利生理學家馬爾比基。
阿蒙森號 [アムンゼン]
曾與奧布殘黨軍的隆德所駕駛的歧途高達金色機「天」交戰的羅拉西亞級MS搭載艦。
根思巴克號[ガーンズバック]
曾與奧布殘黨軍的隆德所駕駛的歧途高達金色機「天」交戰的羅拉西亞級MS搭載艦，其名稱來源於美國科幻雜誌之父雨果·根思巴克。
博尼斯迪爾號[ボーンステル]
曾與奧布殘黨軍的隆德所駕駛的歧途高達金色機「天」交戰的羅拉西亞級MS搭載艦，其名稱來源於科幻作家切斯利·博尼斯迪爾。
倫勃朗號[レンブラント]
曾與奧布殘黨軍的隆德所駕駛的歧途高達金色機「天」交戰的羅拉西亞級MS搭載艦，其名稱來源於十七世紀著名畫家倫勃朗。
納斯卡級
中文譯名：納斯卡級
類型：高速戰鬥艦
製造方：扎夫特
所屬方：扎夫特
尺寸：長255米
重量：未知
推進力：未知
最大搭載數：6部機動戰士
裝備和設計特點：無
首次服役：C.E.71年
固定武器：120mm單裝高能量收束火線炮×2；66mm雙重磁軌炮×2；58mm自動防禦機關炮×10；450mm多用途垂直發射系統×5
納斯卡級戰艦是ZAFT軍開發的戰艦，同時也是ZAFT軍核心戰鬥力量。
已確認艦隻:
威薩利烏斯號 [ヴェサリウス]
ZAFT軍克魯澤隊的旗艦，分類為納斯卡級高速戰鬥艦，全長約255米，艦長為亞迪斯。作為高速艦，本艦的速度可與大天使號媲美，火力也相當強勁。本艦的名稱來源於十六世紀人體解剖學專家威薩利烏斯（維薩里）。
荷爾德林號[ヘルダーリン]
ZAFT軍克魯澤隊的僚艦，分類為納斯卡級高速戰鬥艦，與威薩利烏斯號是同型艦，全長約255米。本艦的名稱來源於十八～十九世紀德國著名詩人荷爾德林。
霍伊金格號[ホイジンガー]
ZAFT軍克魯澤隊的僚艦，分類為納斯卡級高速戰鬥艦，與威薩利烏斯號是同型艦，全長約255米。本艦的名稱來源於十九～二十世紀荷蘭歷史學家霍伊金格。
哈塞爾號[ハーセル]
ZAFT軍在L4的殖民衛星阿莫利萬的駐留艦隊所屬，分類為納斯卡級高速戰鬥艦，在C.E.73年10月2日與聯合軍加迪·魯號交戰後被擊沉。
傅立葉號[フーリエ]
ZAFT軍在L4的殖民衛星阿莫利萬的駐留艦隊所屬，分類為納斯卡級高速戰鬥艦，在C.E.73年10月2日與聯合軍加迪·魯號交戰後被擊沉。
伏爾泰號[ボルテール]
ZAFT軍伊扎克隊所屬，分類為納斯卡級高速戰鬥艦，參加了阻止尤尼烏斯7墜入地球的作戰。本艦的名稱來源於十八世紀法國啟蒙運動的思想家伏爾泰。
盧梭號[ルソー]
ZAFT軍伊扎克隊所屬，分類為納斯卡級高速戰鬥艦，參加了阻止尤尼烏斯7墜入地球的作戰。
ZAFT軍空投運輸艦
ZAFT軍專門為了空投作戰開發的大型運輸艦，一次可以裝載44台MS進行空降作戰，是ZAFT軍空投部隊的重要力量。在高達SEED以及Seeddestiny中都出現了這種MS運輸艦的身影，不論是各種空降作戰還是攻擊天堂島基地都有他們的身影，但自身防禦力差，行動時需要納斯卡級以及蘿拉西亞級保護。
勒塞普斯級
中文譯名：勒塞普斯級
類型：陸地主力艦
製造方：扎夫特
所屬方：扎夫特
尺寸：長250米
固定武器：40cm連裝炮×3；沙漠魚雷發射管×10；VLS（垂直飛彈發射器）×32
雷塞布級是扎夫特在地面上部署的一種大型戰艦。雷塞布級還有這強力的火炮和高度的MS運用能力。在艦體前部兩側和後部分別部署了3門雙聯40cm泡，這種大口徑火炮主要運用於遠距離射擊。艦體上還有著32個垂直飛彈發射裝置和10個魚雷發射裝置來發射大量的飛彈以及沙漠魚雷這種特殊武器。除此之外還有著34個發射器用於發射箔條、信號彈或煙霧彈。強大的MS運用能力也能從巨大的格納庫體現出來。不過雷塞布級並未裝備線性彈射器，而是讓MS直接通過艦上的艙門出擊。艦身周遭包括正面部分共有15個部位設置了MS艙門。
已確認艦隻:
勒塞普斯號[レセップス]
ZAFT軍巴爾特菲爾德隊的旗艦，分類為勒塞普斯級大型陸上戰艦，全長250米。艦首中央設有MS甲板，可收容巴庫、拉古等機體；艦底部為沉入沙中的半沒式船體，其中裝備的推進器可使艦體以無振動推進的方式在沙漠中航行。本艦的名稱來源於十九世紀主持建設蘇伊士運河工作的法國外交家費迪南德·德·勒塞普斯。
雷茲蒙德號[レズモンド]
ZAFT軍馬哈穆爾基地所屬拉多爾隊的旗艦，分類為勒塞普斯級大型陸上戰艦，全長250米。艦首中央設有MS甲板，可收容巴庫、拉古等機體；艦底部為沉入沙中的半沒式船體，其中裝備的推進器可使艦體以無振動推進的方式在沙漠中航行。本艦曾於C.E.73年和密涅瓦號一起參加了對聯合軍加爾納漢基地的攻擊戰。
皮特利級
中文譯名：皮特利級
類型：陸地支援艦
製造方：扎夫特
所屬方：扎夫特
尺寸：長194米
固定武器：主炮×8；飛彈發射管×16
扎夫特在地球上部署的陸上戰艦之一，皮特里級和雷塞布級一樣配備了鱗片馬達用來在沙漠中穿行。皮特里級依然有著一定的MS搭載能力，可以攜帶幾台TMF/A-802巴庫、TFA-2 扎烏特以及TMF/S-3沙漠戰樣式金恩等。
已確認艦隻:
亨利·卡特號[ヘンリー·カーター]
ZAFT軍巴爾特菲爾德隊的僚艦，分類為皮特利級陸上戰艦，全長約194米。艦底部為沉入沙中的半沒式船體，其中裝備的推進器可使艦體以無振動推進的方式在沙漠中航行。
皮特利號[ピートリー]
ZAFT軍巴爾特菲爾德隊的僚艦，分類為皮特利級陸上戰艦，全長194米。艦底部為沉入沙中的半沒式船體，其中裝備的推進器可使艦體以無振動推進的方式在沙漠中航行。
巴格利號[バグリー]
ZAFT軍馬哈穆爾基地的拉多爾隊所屬，分類為皮特利級陸上戰艦，全長約194米。艦底部為沉入沙中的半沒式船體，其中裝備的推進器可使艦體以無振動推進的方式在沙漠中航行。本艦曾參加了C.E.73年的對聯合軍加爾納漢基地的攻擊戰。
康普頓級
中文譯名：康普頓級
類型：陸地主力艦
製造方：扎夫特
所屬方：扎夫特
尺寸：230米
固定武器：2門三聯加農炮、2門雙聯光束炮，4門四聯機炮。還有這多達32個重型飛彈發射器以及20個防空飛彈發射器。
康普頓級是扎夫特在第二次聯合-PLANT戰爭中部署的最大型的地面戰艦，長達230米。康普頓級不僅武器種類多，作戰能力強，還可以攜帶大量MS，至少可以搭載30台以上。不過和之前使用的地面戰艦不同的是，康普頓級使用的是傳統的履帶進行移動而非鱗片馬達。
以確認艦隻:
烏倫貝克號[ユーレンベック]
本艦是康普頓級大型陸上戰艦，曾於C.E.73年參與攻擊大天使號，指揮官為威拉德。
博茲格羅夫級
中文譯名：博茲格羅夫級
類型：潛水主力艦
製造方：扎夫特
所屬方：扎夫特
尺寸：約270米
固定武器：對空飛彈莢艙×12；魚雷發射管×12
本艦是ZAFT軍在地球圈內作戰極其重要的力量，不論是攻擊阿拉斯加基地還是巴拿馬基地亦或者是天堂島基地，它都是急先鋒，承擔著輸送MS以及回收MS的重任。
已確認艦隻:
克斯特號[クストー]
ZAFT軍莫拉希姆隊的旗艦，分類為博茲格羅夫級潛水母艦，全長約270米。艦首設有4個乾燥管以收容MS，其名稱來源於發明家傑克·克斯特。
尼拉貢戈號[ニーラゴンゴ]
ZAFT軍戰艦，分類為博茲格羅夫級潛水母艦，全長約270米。艦首設有4個乾燥管以收容MS，其名稱來源於剛果境內的火山。本艦在與密涅瓦號一同前往直布羅陀基地的途中被奧爾·尼達駕駛的深淵高達擊沉。
岡瓦納級
中文譯名：岡瓦納級
類型：大型宇宙空母
製造方：扎夫特
所屬方：扎夫特
尺寸：1200米
固定武器：八門加農炮和八門雙管加農炮
已確認艦隻:
岡瓦納號[ゴンドワナ]
本艦是岡瓦納級大型宇宙空母，全長1200米，可以攜帶數百台MS。而這些MS也可以通過艦上多達16條線性彈射器迅速部署。除了搭載的龐大數量MS外，岡瓦納級上還有許多用於運送物資和人員的船塢。這艘龐大的巨艦有著凌駕於其他戰艦的MS運用能力以及指揮管制功能里，其規模甚至堪比要塞。曾於C.E.73年的反擊戰中登場，艦名來源於古大陸岡瓦納。
密涅瓦號
中文譯名：密涅瓦
類型：高速戰鬥艦
製造方：扎夫特
所屬方：扎夫特
尺寸：長320米
重量：未知
已確認的艦隻：密涅瓦號
首次服役：C.E.73年
固定武器：QZX-1「Tannhauser」陽離子破城炮；XM-47「Tristan」光束炮×2；M10「Isolde」420mm投射炮；40mmCIWS（CloseIn Weapon System）×12；飛彈發射器；WolframM-25前部魚雷發射器，位於艦首兩側。
可選武器：飛彈發射器可選：「Neidhart」ASM/S宇宙用飛彈，Parsifal ASM/A對地用飛彈，Dispar AMM攔截飛彈。
本艦是ZAFT為了新千年系列高達而建造的最新型戰艦，識別號為LHM-BB01，可以在宇宙、空中及海上航行。其最大的特點在於有朝左右伸展的翅膀與特殊能源傳達機構的發射端——氘核光束供電系統。
艦體左右的發進通道由一般MS用，中央艦橋下的發射器是脈動高達專用的。本艦一共有3個MS停機甲板。QZX-1「Tannhauser」是裝備在艦首的巨型陽電子炮，平常保持收納狀態，使用時會將外部裝甲展開，使炮身本體出現，有著一擊能將戰艦擊沉的巨大威力。
XM-47「Tristan」大口徑光束炮裝備在艦體左右的MS停機甲板上方，共計4門，使用在通常的戰鬥上，在對艦戰鬥中擔當主要角色。
本艦的其中一項防禦武器是反光束爆雷，這中暴雷能產生防護膜，能折射光束攻擊。飛彈發射器裝有「Neidhart」ASM/S宇宙用飛彈，在大氣圈內戰鬥時改為Parsifal ASM/A對地用飛彈。
M10「Isolde」420mm投射炮是裝備在艦體中央部分的三連主炮，通常是收納在艦身內部，戰鬥時則是展開來使用，與大口徑光束炮並列，都是在通常戰鬥中發揮重要作用的武器。
本艦的艦長為塔麗亞·格拉迪斯，艦名來源於古羅馬神話中掌管智慧、戰爭及工藝的女神的名字。
永恆號
中文譯名：永恆號
類型：MS專用支援艦
製造方：扎夫特
所屬方：三艦聯盟
尺寸：長300米
重量：未知
已確認的艦隻：永恆號
首次服役：C.E.71年10月
固定武器：飛彈發射台；光束炮×1，固定在艦橋前方；機關炮
扎夫特的運輸艦永恆號是專門為了支援ZGMF-X09A 正義高達/Justice Gundam和ZGMF-X10A 自由高達/Freedom Gundam而設計的。除了作為兩台機動戰士的基地外，永恆號也作為METEOR的存放平台。永恆號有一個為收容和放出高達而設的內部修理庫和直線彈射器，然而，METEOR是停放在艦體前端外壁的。作為一艘運輸艦，永恆號只裝備了飛彈發射台、機關炮和光束炮。在戰爭的後期，永恆號被拉克絲·克萊恩和她的支持者所奪取，並與離開聯合軍的戰艦大天使號和奧布戰艦草剃號組成獨立於聯合軍和扎夫特的三艦聯盟。艦長為「沙漠之虎」安迪·巴爾特菲爾德。
ZAFT軍的戰艦從宇宙到陸地再到水裡，建立了一套完整的戰艦運用體系，在戰爭中發揮了重要的作用。到這裡ZAFT軍的戰艦就介紹完了，有不足的地方還請大家指正。