汽車檢測與維修技術
汽車檢測與維修技術專業是新疆石河子職業技術學院開設最早、招生就業人數最多的專業之一,教學實訓設備接近1000萬規模，專業教師、學生多次在國家級、省級技能大賽中獲獎， 2017年成為自治區首批招收汽修專業士官生的專業，2018年成為「國家級汽修高技能實訓基地建設專業，2019年成為國家首批汽修″1+X″證書制度試點專業，試點人數過關率100%。
專業分為汽油轎車檢修方向和面向火箭軍就業的柴油重卡汽車檢修方向。培養旨在能夠擔任汽車檢測、診斷、維修等流水線的組織、指導、管理的技術應用型人才。
就業方向:汽車維修企業的檢測與診斷、維修與保養、生產與營銷、汽車鑑定評估及火箭軍部隊重卡汽車維修、技術管理等崗位。
電氣自動化技術
電氣自動化技術專業2005年起開始招生，2009年起參加全國職業院校技能大賽，並多次獲獎。2017年，學院成為新疆唯一招收電氣自動化技術專業士官生的高職院校。
本專業採用「工學結合、理實一體化」教學模式，著力為自治區、兵團和全軍培養電氣自動化系統控制、操作、調試、生產運行與維護方面的應用型人才。
就業方向：從事電氣類、控制類等行業設計、開發、運行管理，自動化生產設備及控制系統的運行、維護和管理，電氣及自動化設備、檢測儀器儀表的設計開發、市場營銷和售後服務等工作。
機械製造與自動化
機械製造與自動化專業開設於2010年, 2017年成為自治區首批士官專業之一，培養具備機械製造基礎知識與應用能力，能在工業生產第一線從事機械製造領域的設計製造、設備的操作、調試與維護的高素質技術技能人才。專業師資力量雄厚、實訓條件優良，建設有機械製造、加工中心等9個校內教學實訓室， 2019年榮獲自治區職業院校技能大賽二等獎和三等獎。畢業生初次就業率96%以上，用人單位對畢業生的滿意度極高。
就業方向：機械產品的製造與裝配、計算機輔助設計、質量分析和檢驗；機電設備的操作、調試、維護、生產現場管理和技術銷售等。