生信寶典
臨床外顯子組測序分析中的那些坑（上）
大規模並行測序技術或下一代測序已成為基因診斷和研究的標準技術，尤其是外顯子組和基因組測序現在已經在世界範圍內廣泛應用於患者的分子診斷。在過去幾年中，許多實驗室都在努力應對基於全新技術建立基因檢測工作流程的挑戰。測序技術中持續引入新的儀器、化學和分析方法加劇了這些挑戰。
新型單鹼基解析度測序方法可同時獲取DNA的遺傳和表觀遺傳信息
DNA中存儲著多個維度的信息，包括遺傳和表觀遺傳基礎中的分子信息，這兩者都對我們理解生物學至關重要。DNA序列中的遺傳信息使我們認識到基因和調控原件賦予了生命的藍圖；DNA中的表觀遺傳信息，使我們發現根據基因藍圖構建生命的指示標和控制台。
外顯子和基因組基本概念(一)
聊生信團隊近期梳理了一些外顯子和基因組相關的基本概念，便於理解後續的相關生信分析。基因組:分子生物學和遺傳學領域中指生物體所有遺傳物質的總和，包括DNA或RNA。
院士專家共議：生物信息學的下一個十年
轉自：中國科學報「十年來，數學、計算機與生命科學交叉領域發生了顯著的變化，如今伴隨著大模型、人工智慧等給我們提出了巨大挑戰，也到了學科必須『交叉』的時候，這無論對現代科學的發展，還是服務國家戰略需求，都是非常重要的。
國際上最大的基於中藥活性成分的藥物轉錄圖譜平台ITCM
然而，基於中藥活性成分的快速計算篩選平台十分匱乏，阻礙了中藥現代化的進程。近日，海軍軍醫大學藥學系張衛東教授團隊在國際生物信息學權威雜誌Briefings in Bioinformatics 【IF:13.994】上發表文章Exploring pharmacological active ingredients of traditional Chinese medicine by pharmacotranscriptomic map in ITCM，該研究開發了目前最大的基於中藥活性成分的藥物轉錄圖譜平台。
ISME Comm | 機器學習和深度學習在微生物組研究中的應用
Review Article，2022-10-06，ISME Communications，DOI:見原文連結。
跟著iMeta學做圖｜ggplot2繪製相關性分析線面組合熱圖
本文代碼已經上傳至https://github.com/iMetaScience/iMetaPlot230118corr 如果你使用本代碼，請引用：Changchao Li. 2023.
Pan起來！基於Cell數據發一篇Genome biology
Pan起來~~~ 基於Cell數據發一篇Genome biology - 中科院田誌喜研究組解析大豆三維基因組遺傳多樣性染色質的高級結構是基因組中順式作用元件發揮功能的先決條件，其在基因表達調控中發揮著重要作用。
外顯子和基因組基本概念(一)
聊生信團隊近期梳理了一些外顯子和基因組相關的基本概念，便於理解後續的相關生信分析。基因組:分子生物學和遺傳學領域中指生物體所有遺傳物質的總和，包括DNA或RNA。
機器學習 - 隨機森林手動10 折交叉驗證
隨機森林的 10 折交叉驗證再回到之前的隨機森林（希望還沒忘記，機器學習算法-隨機森林初探（1））library(randomForest)set.