他又回來了，菲律賓人民沸騰了，70000日軍的末日到了
1944年10月16日，麥克阿瑟登上「納什維爾」號重巡洋艦，向菲律賓進發。跟隨他的是克魯格中將率領的美軍第6集團軍20萬官兵；負責運輸和掩護任務的是金凱德中將指揮的美國第7艦隊的700餘艘艦船；哈爾西中將的美國第3艦隊則負責牽制日本聯合艦隊；肯尼中將指揮的戰區空軍擔負奪取和保持制空權。同行者還有菲律賓總統奧斯梅納。
麥克阿瑟進攻的第一個目標是菲律賓的萊特島。20日拂曉，開進雷伊泰灣內的美軍戰列艦開始炮擊北起塔克洛班、南至杜拉格的登陸地段。隨後，巡洋艦、驅逐艦駛進萊特島，在近距離實施更猛烈的炮擊，整個海岸線成了一片火海。9時45分，美軍數百艘登陸艦艇擁向海岸灘頭，太平洋戰爭中規模最大的登陸戰打響了。美軍登陸部隊兵分兩路沖向海灘，很快建立了數十平方公里的登陸場。
下午1點多鐘，麥克阿瑟身穿一套嶄新的咔嘰布軍裝，嘴裡叼著玉米芯菸斗，戴著一副墨鏡，乘坐一條駁船向岸邊駛去。駁船上除了各級軍官和新聞記者之外，還有菲律賓總統奧斯梅納和羅慕洛將軍。在距岸邊幾十米的地方，駁船放下了舷梯，麥克阿瑟將軍一行涉水上岸。在海灘上，麥克阿瑟拿起麥克風，通過無線電台發表了講話:我是麥克阿瑟將軍。菲律賓人民，我回來了！托萬能之主的福，我們的軍隊又站在菲律賓這塊活著我們兩國人民鮮血的土地上了。
我們為摧毀統治你們的殘餘天，為恢復不屈不撓的力量的基礎一你們民族的自由，回來了！…在隨後占領整個萊特島的近兩個月作戰過程中，美軍以傷亡約1.5萬人的代價，使日軍約7萬人被擊斃或病餓而死。戰役結束後，菲律賓政府授予麥克阿瑟一枚勇敢勳章；馬歇爾將軍也打來賀電，並通知他:美國眾、參兩院已分別於12月11日和12日通過法案，定授予他陸軍五星上將軍銜。1945年1月，麥克阿瑟在萊特島站穩腳跟後，又開始實施呂宋島登陸戰役，目標是奪取馬尼拉。
1月9日，美軍20萬官兵在當年本間雅晴率領日軍登陸的同一地點一林加延灣登陸。2月初，美軍包圍馬尼拉，至月底終於占領了馬尼拉。2月27日，麥克阿瑟來到菲律賓總統府一馬拉卡南宮宣布，「將憲法規定的一切權利和責任交還給菲律賓共和國政府」，並希望它能夠成為「東方的民主堡壘」。3月6日，麥克阿瑟把家人從布里斯班接到馬尼拉，安置在一所帶有游泳池的豪華住宅里。