公元1644年，李自成軍攻入北京，崇禎皇帝殉國，留下三位年幼皇子，他們就是太子朱慈烺、三皇子定王朱慈炯、四皇子永王朱慈炤。
李自成俘虜了他們，不久卻在山海關敗於清軍，兵敗西歸途中，便將三個皇子放走，讓他們自謀生路。
李自成與明朝太子朱慈烺：

清軍入關時，是打著「幫明朝報仇、剿滅李自成軍」的旗號。攝政王多爾袞更冠冕堂皇宣布，要「善待」和「恩養」明朝宗室。斷了一臂的長平公主也被安置在其外祖父周奎府上，與駙馬周世顯成婚。
然而，沒過幾個月，太子朱慈烺到周奎府上，與長平公主相認。公主和弟弟抱頭痛哭，（【相見掩面泣，奎跪獻酒食】），多爾袞和清廷卻硬說此人是假冒太子，將他橫加殺害。
長平公主遭此錐心之痛，萬念俱灰。沒過多久，已懷有四個月身孕的長平公主，母子皆亡，或許是服毒自盡，亦可能是被清廷殺人滅口。
公元1646年，李自成殞命，南京弘光政權同樣覆滅，八旗兵鋒已經席捲了神州大片疆土，清廷認為明朝宗室再無可資利用的政治價值，便隨口用了「私藏金銀印信」「意欲勾結（南明）」「謀逆為亂」等藉口，大肆株連，將被俘虜的弘光帝（福王）朱由崧，以及被羈押在京的所有明朝近支宗室，包括潞王朱常淓、衡王朱由棷、晉王朱審烜、荊王朱慈煃、周王朱紹烿、德王朱由櫟、秦王朱存烳等，及其子孫後人，盡數處決於京城菜市口！

同年，清廷更公開發布諭旨：【凡故明宗室……若窮迫降順，或叛而復歸，及被執獻者，無少長盡誅之！】（明朝朱氏宗室，如果是迫於無奈才投降，或者反抗過滿清卻又投降，或者被屬下挾制投降，無分年齡老少，全部斬首！）
公元1646年8月，清軍攻滅福州的隆武政權後，將被俘虜的隆武帝（唐王）朱聿鍵、益王朱慈炲殺害。
公元1646年12月，清軍攻陷廣州，滅亡紹武政權後，製造了駭人聽聞的廣州大屠殺，在長達十二天的時間內，殺害全城婦孺老幼數十萬人。
此外，清軍更將被俘虜的紹武帝朱聿鐭，以及「周王朱肅罒、益王朱思厶、遼王朱術雅、鄧王器檙、鉅野王朱壽鋤、通山王朱蘊鉞、高密王朱弘椅、仁化王朱慈魶、鄢陵王朱肅汭、南安王朱企壠、周王世子朱恭棎、遼王世子朱儼鐐」等24名明朝藩王及其子孫，一併殺害。
在清軍分兵攻略各地時，同樣對捕獲的明朝藩王大肆殺戮，根據《清實錄》統計，遇害名單包括：樊山王朱常闒、樂安王朱誼石、 曲陽王朱盛渡、西河王朱盛淦、松滋王朱演漢、西城王朱通簡、瑞昌王朱誼氻、遂平王朱紹鯤、金華王朱由搵、高安王朱常淇、魯王朱鼎兆、宜春王朱議衍、貴溪王朱常彪、鄖西王朱常湖、南威王朱寅衛、長沙王朱由櫛、延長王朱識駉、東安王朱盛蒗、楚王世孫朱盛治……
以及在清廷記載中，誤記為「蜀王」的楚藩宗室朱盛濃、忽略了王號，只籠統稱為「故明王」的朱常渶、朱由槓、朱常洊等人。
公元1662年，清軍攻滅南明永曆政權，永曆帝（桂王）朱由榔、太子朱慈煊以及其親眷二十五人，被絞殺於昆明。
永曆帝遇害塑像：

公元1668年（清朝康熙七年)，在清廷基本撲滅了神州大陸的反清烽火後，康熙帝愛新覺羅·玄燁終於宣布，從此對明朝朱氏宗室「網開一面」，放他們一條生路：「詔故明宗室子孫眾多，有竄伏山林者，令悉歸田裡；有改姓埋名者，姓氏皆復舊。」
可是，被清廷的血腥殺戮了二十餘年的朱氏子弟，又豈敢當真？說穿了，這不過是清廷令海內聞風，誘使明室後裔自投羅網，然後加以翦除的毒計。
公元1679年，崇禎三皇子、定王朱慈炯，被清廷捕獲。原來他於甲申國破後，遁入空門，出家為僧，逃亡了三十多年。當吳三桂「三藩之亂」爆發後，他被一夥趁亂起兵的草莽之士裹挾，從此陷身於湘中地區。
朱三太子：定王朱慈炯

滿清安親王岳樂的大軍，進剿武岡州楓木嶺，將他抓獲，解送京師。
然而，清廷當即翻臉，宣布：「彼時朱慈炯年甚小，必不能逸出，今安得尚存？大約是假」，便又一回指鹿為馬，以「假冒前朝皇子，謀反作亂」，將朱慈炯處死！
公元1683年，清軍攻占台灣，滅鄭氏政權。流亡在此的眾多明朝宗室，奉南王朱和睦、益王朱怡鎬、舒成王朱慈喜、樂安王朱義浚、巴東王朱尊柬、瀘溪王朱慈著、瀘溪郡府將軍朱慈某、奉新郡府將軍朱慈廣、魯王世子朱弘桓等人，清廷收繳其譜牒和印信，安置於山東、河南等地，令其務農為業，以示寬仁。
公元1699年，康熙帝在南京拜祭明太祖朱元璋的陵墓，以此收買人心，又召諭天下，要「訪察明室後裔，授以職銜，俾其世守祀事。」
然而，5個月後，地方官便回報：「明亡已久，子孫湮沒無聞，今雖查訪，亦難得實。」足見清廷根本不承認之前在台灣俘獲的那批遠支宗室的身份，令他們泯然眾人，淪為愚氓罷了。
公元1708年， 崇禎帝四皇子， 永王朱慈炤（化名王士元）被清廷發現，雖然他此時已經是75歲高齡，垂垂老矣，安心在清朝治下隱姓埋名，做了六十多年的順民，并力辯自己根本無「反清復明」之念，卻還是慘遭清朝殺害。

康熙帝宣布：朱慈炤「雖未必有反清之行，但未必無反清之心！」，將朱慈炤千刀萬剮，凌遲處死！

朱慈炤的六個兒子，都被斬首，他年幼的孫子朱鈺寶死於獄中。
朱慈炤的一妻一妾，三個女兒，都在清兵抓捕時自盡，全家十三口盡數遇害，無一倖免。

大明崇禎皇帝的血脈，甚至是此前泰昌皇帝、萬曆皇帝、隆慶皇帝、嘉靖皇帝的全部血脈，至此斷絕！
公元1724年（雍正二年），雍正帝胤禛宣布，此時擔任正定知府的官員朱之璉，是明太祖第十三子代王朱桂的後裔，封他為一等延恩侯，負責明孝陵的祭祀，並以此標榜清朝對明朝及其後裔何等追崇，超越歷朝：「我朝列聖，加禮勝代，至隆極渥，超軼前古。」
然而，這個朱之璉根本就是個冒牌貨！
雍正帝冊封他的聖旨，便是漏洞百出：
【查得廂白旗朱文元，系明太祖第十三子代簡王之後。明崇禎時，簡王宗室代王，為洪承疇監軍於松山。我太宗文皇帝時，代王與伊侄文元，同被俘獲。遂歸我朝。曾蒙聖祖仁皇帝召見，親詢宗系。今原任內閣侍讀學士朱汝錩之子眾關保等，俱文元之孫也……今見任直隸正定府知府朱之璉一支是也。】
然而，末代的代王朱傳㸄，於公元1644年，李自成攻陷大同，全家被殺。
松山大戰時，洪承疇所部明軍，也根本沒有什么子虛烏有的親王和宗室監軍。被清軍俘虜的「監軍代王」與他的侄子朱文元，更是清朝捏造的人物。更不用說他們的取名，完全不符合朱元璋給代藩定下的「遜仕成聰俊，充廷鼐鼎彝，傳貽連秀郁」的譜系，和第三字必用「金木水火土」為偏旁的規定了。
朱之璉既然被宣布為「朱文元」的後人，當然也是冒牌西貝貨無疑。
其實，當時明朝遠支宗室還有多人健在，繁衍子孫，比如上文提到的曾逃亡台灣的那些宗室，只是清廷認為一旦給了某宗室以禮遇和爵位，讓他成為了明朝後裔的代表和旗幟，重新有了影響力，便會成為自己的心腹之患；
才刻意用朱之璉這麼一個死心塌地的清朝地方官、謊言一戳就破的假宗室來代替，這樣就規避了所有將來可能的風險。
雍正帝胤禛不愧是將帝王權術修煉到極致的人物，才會製造了這樣一個彌天大謊。
而朱之璉的子孫後人，就這麼一代代傳襲著延恩侯的爵位，雀占鳩巢地占據了本屬於朱元璋後人的隆遇，整整二百餘年，延續到了清朝滅亡為止，甚至在清朝滅亡後，還死心塌地追隨溥儀的紫禁城小朝廷。
朱之璉塑像：

甚至時至今日，還有很多清史學家和歷史愛好者，真以為清朝延恩侯一脈，是正牌的明朝朱氏後裔，反將陸續慘死在清廷屠刀下的崇禎帝三位皇子，太子朱慈烺（1629年~1644年，享年15歲）、定王朱慈炯（1632年~1679年，享年47歲）、永王朱慈炤（1633年~1708年，享年75歲），當成是假冒呢。
他們不但遭逢大難，身首異處，卻還要背負清廷強加的「冒名頂替」之名，千載之下，慘痛之極！