就在黑死病這種大瘟疫肆虐整個歐洲的時候，在中國這片土地上，有一名年輕人卻嶄露頭角，他就是後來威震整個華夏，建立大明王朝的明太祖朱元璋。
眾所周知，明朝是一個非常強大的王朝，歷經二百七十六年，16位皇帝，當時的大明帝國可以說是世界上最強大的國家了，然而物極必反。明朝末年，饑荒瘟疫等四處橫行，而壓死明朝的最後一根稻草，恰恰也是鼠疫，這種可怕的疾病在歐洲反覆三百多年。奪走了無數人的生命，而它現在正磨刀霍霍奔向亞洲。明朝時期，中國北方邊界多次發生戰亂，導致部分漢人逃亡蒙古草原，他們將牧場開墾成了農田，擠占了草原上老鼠的生存空間，為明末的大鼠疫埋下了伏筆。
明朝末年曾發生多次旱災，僅萬曆年間有記載的大旱就多達三次。再加上明朝末年全球氣候經歷了一次小冰河時期，更使得農業遭受重大打擊，大量農田顆粒無收。有的人掏老鼠洞裡儲存的糧食為生後來有人開始吃老鼠，鼠疫就這樣爆發了。同時旱災和疫情導致大量人口淪為了難民，流動的人口更使得疫情無法得到控制，鼠疫先是在山西集中爆發，隨後傳往河北，陝西等周邊省份，崇禎十四年，鼠疫傳到北京大名府。再加上大名府當年一滴雨都沒下，最終導致病餓而死的人高達三成。
而就在京城瘟疫橫行的四年前，也就是崇禎十年，鼠疫疫情傳到了陝西米脂，同樣導致這裡大量人口患病，情況異常悽慘。而在這裡的一名年輕人，將親手成為風雨飄搖的明朝的掘墓人，他就是李自成。由於戰亂和饑荒，他帶領的這些農民起義軍一路高歌猛進，來到了北京城下。
而這時等待他們的北京成已經被鼠疫折磨的千瘡百孔了，原來守衛京城的三大營軍隊，在鼠疫過後存活下來的僅有五萬人左右，這些殘兵敗將們，平均每個士兵都要防守三個垛口。而他們都是在瘟疫中僥倖存活下來的，身體素質與此前相比已經有了巨大的差距，據記載，當時守衛京城的士兵們，虛弱的坐在地上，鞭子抽都抽不起來，毫無作戰意志，這種情況下又怎麼能擋住李自成的農民起義軍呢？
正因如此，李自成順利的拿下了北京城，改國號為大順，然而李自成卻在稱帝後的第二天就倉皇退出了北京。因為清軍打了進來，為何能將明朝打敗的李自成卻打不過清軍呢？事實上，李自成的起義軍更像是一幫由災民組成的烏合之眾，他們跟隨李自成燒殺搶掠的原因很簡單，就是以戰養戰，否則他們就會被餓死，而李自成能夠攻入北京，很大程度上是因為鼠疫的原因，而李自成撤出北京的原因同樣簡單，那就是他的起義軍們也患上了鼠疫，面對清軍的騎兵難以招架。
問題來了，清軍曾與李自成的軍隊有過親密接觸，為何他們卻沒有患上鼠疫呢？後來人們查閱史籍才發現，歐洲大瘟疫中，唯有騎兵躲過了一劫，所以史學界認為，可能是傳播鼠疫的跳蚤不喜歡馬身上的氣味，而清軍主要由騎兵組成，自然就不會感染鼠疫了。