還珠格格第二部結尾，兩對情侶經歷種種磨難終成眷屬。而到了第三部，
美好的愛情童話並沒有延續，他們依然要面對生活中的各種問題。
而小燕子更是遭受了三重打擊，最終離開了皇宮。
一、親情
在第二部中，小燕子的身世之謎揭開，她的親生父親是方之航，因一首剃頭詩被人陷害入獄並斬首，母親把他們兄妹兩人一個南一個北的託付於人就殉情了。小燕子由奶娘帶著準備送到京城的一位世伯家，但奶娘半路昏倒在尼姑庵前，小燕子就被靜慧師太收養。後來有一次小燕子偷溜出去看燈會就沒有再回來，輾轉遇到了柳青柳紅。多年以後，又結識了紫薇和金鎖並收留她們在大雜院。陰差陽錯又進了宮成為了皇上的義女，深得皇上的喜愛。在宮外與簫劍不打不相識並最終相認。
皇上十分喜愛小燕子，讓她感受到了從未有過的親情。第一二部里皇上與小燕子的親情也是一大看點，而到了第三部全變了。皇上成了小燕子的仇人，是殺害全家的罪魁禍首，即使後來查清是誤會，還了方家清白。可傷害已經造成，小燕子失去了孩子，五阿哥被迫娶了知畫。而皇阿瑪也因小燕子的不爭氣早已心生怨氣，父女親情早已被現實打擊的所剩無幾。直到最後在雲南皇上千里迢迢看望離宮許久小燕子，小燕子也終於再一次的感受到了久違的親情。
二、友情
第一二部最讓觀眾感動的是小燕子和紫薇的友情。她們對彼此真心相待，就算是面對生死也從未放棄。在第三部中，兩人都擁有了自己的小家庭，紫薇更是將自己的全部心思放在了兒子冬兒身上。姐妹之情漸漸變淡，紫薇夫婦甚至勸五阿哥早日與知畫圓房，全然不顧小燕子的心情，讓她接受與知畫分享永琪的愛。在小燕子因為知畫傷心痛苦的時候，只有晴兒是真心為她著想，點醒了永琪。大結局時，紫薇也沒有到雲南去看望小燕子，更是與知畫成為了閨中密友。哪怕是讓爾康帶去一封信也是好的。只能說隨著時間的流逝，再好的閨蜜也經不起時間與距離的考驗。
三、愛情
第一二部的永琪深愛著小燕子，為了能和小燕子在一起做出了許多努力，甚至不惜與老佛爺對抗，最終有情人終成眷屬。而第三部老佛爺用小燕子的身世之謎逼迫永琪娶了知畫，雖然他一再保證不會動心，不會愛上知畫，可現實卻很殘酷。因為各種原因他還是喜歡上了知畫並且有了孩子，直到看清了知畫的真面目，和小燕子放棄一切來到了雲南大理。但是在大理的每一天他從來沒忘記過知畫，這點小燕子很清楚。知畫永遠隔在兩個人中間，無法忽視。兩個人的感情再也不像以前那樣純粹。
小燕子遭受了親情友情愛情的三重打擊，皇宮對於她來說就是個大牢籠，燕子只有在牢籠之外才能自由飛翔，離開皇宮是最好的結局。