早篩網訊：近期，持續深入布局三代測序的貝瑞基因又有大動作。由貝瑞基因提供技術支持的三代CAH（先天性腎上腺皮質增生症）臨床回顧性研究成果，發表於檢驗醫學排名第一的頂級國際學術期刊 Clinical Chemistry（即時IF=11.784）。
論文首頁截圖
從技術層面看，這是國際上首次運用分子診斷技術探索CAH分子機制，為CAH篩查診斷及遺傳諮詢帶來全新解決方案。放到公司核心戰略的視野下進行考量，貝瑞基因科研先行、硬體提速、產品落地的三代測序漸進式布局，在這個火熱的賽道中逐漸占據高地，展現出先發優勢。
貝瑞基因三代測序全景規
貝瑞基因
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技術領先：一次到位檢測所有相關基因變異類型
了解三代CAH這項技術前，先讓我們來了解一下CAH。
先天性腎上腺皮質增生症（Congenital Adrenal Hyperplasia，CAH）是世界上最常見的常染色體隱性遺傳病之一，會導致腎上腺皮質功能不全、生殖器模糊或性發育障礙、不孕、身材矮小以及青春期和成年期代謝綜合徵風險增加等，嚴重者可致命。
傳統基於類固醇激素水平的CAH篩查方法（時間分辨螢光分析法TRFIA、液相色譜-串聯質譜LC-MS/MS）特異性低，假陽性率高，會增加家長不必要的精神負擔。而且無法及時明確疾病根源的致病基因型，會造成確診速度慢或誤診。
而基因檢測在CAH篩查上也面臨著「真假基因」的挑戰。真基因CYP21A2和假基因CYP21A1P基因同源性高達99.8%，即便採用長片段PCR、多重連接探針擴增（MLPA）、序列分析等多種方法聯合也難以進行區分，易導致假陰性/陽性結果。此外，傳統基因檢測方法無法精確檢測大片段重複基因型，難以對缺失類型進行精確分型，對於不同致病性變異的複合雜合子為順式還是反式結構還必須進行家系分析，無法一步到位。
貝瑞基因長期從事罕見病和基因病的診斷，布局三代測序的初衷，就是希望與一代、二代測序形成互補，為臨床帶來更多的診斷方法。
單分子實時測序、長讀長、無需PCR擴增等優勢，將其應用於CAH篩查，可以全面提升效率和精度：
● 可在同一反應管中同時檢測數百種CAH突變；
● 可輕鬆區分傳統PCR方法及NGS無法檢出的真假基因，精準識別大片段缺失/重複及不同缺失型變異的亞型；
● 不依賴於家系分析，直接區分順/反式變異；
● 可通過新生兒干血斑、外周血等樣本中的痕量DNA進行三代長讀長測序和生物信息分析，不受代謝等其他因素影響，實現對目標基因精準覆蓋。
此次臨床回顧性研究顯示，貝瑞基因三代CAH產品可彌補傳統CAH檢查手段流程繁瑣周期長，且無法全面檢測所有變異類型等不足，對CAH涉及相關基因的SNV/InDel/CNV、拷貝數異常、假基因、基因重排實現「一網打盡」。
圖：三代CAH的基因變異結果展示
圖：三代CAH家系樣本檢測結果
同時，三代CAH可以縮短病因排查周期，實現篩診一體，幫助患兒及時確診與儘早干預，避免家長來回奔波重複採樣，實現一種技術一次到位檢測所有CAH相關基因變異類型。
圖：三代CAH與MLPA+Sanger測序進行比較
據了解，未來三代CAH將極大促進CAH的快速分子診斷，在攜帶者篩查、新生兒篩查、患者診斷及產前診斷中擁有廣闊的臨床應用前景。
事實上，對於三代測序的布局，貝瑞基因一直保持著相當穩健的節奏。此次三代CAH臨床回顧性研究成果重磅發布，正是從科研、硬體、產品三大維度發力三代測序的一個縮影。
近年來，貝瑞基因在三代測序領域開展了多項重磅臨床研究並取得豐碩成果。2021年1-6月，公司發起了地中海貧血基因圖譜（TiGA）計劃，與南方13個地貧高發省份的43家地貧防控權威醫院合作，納入5055例臨床疑難樣本進行三代地貧檢測，將罕見型α地貧和β地貧的基因診斷率分別提升約40%和60%。
2021年7月，由貝瑞基因提供技術支持的三代地貧多中心臨床前瞻性研究成果在分子診斷期刊 The Journal of Molecular Diagnostics 上發表，研究證明三代地貧覆蓋全面、精準度高、適用性廣，有助於提升全球地貧攜帶者篩查的效率和精度。
貝瑞基因的科技服務板塊，三代測序下機數據也有硬核產出：PacBio Sequel IIe 測序儀單Cell 的HiFi數據產出已突破45Gb。HiFi Reads長度均值達16kb，質量均值為Q34，兼具了高精度和長讀長，持續為三代科研保駕護航。
醫療器械註冊臨床試驗階段。2021年年初，雙方又攜手開發三代桌面測序儀，以此服務中國臨床多層次的需求。目前，貝瑞基因共擁有21台 PacBio Sequel II/IIe 測序儀，實力雄厚可見一斑。
在此基礎上，公司以單基因遺傳病為切入點，落地了三代地貧、三代CAH和三代SMA（脊髓性肌萎縮症）等產品，極大豐富了在生育健康和遺傳病檢測的產品管線。其中，貝瑞基因三代地貧檢測試劑盒近日取得醫療器械註冊倫理批件，進入臨床試驗階段。三代SMA產品，則可大大改善SMA患者基因診斷及預後判斷，提高SMA新生兒基因篩查的效率，將SMA攜帶者篩查的殘餘風險降低4-5倍。
貝瑞基因三代地貧檢測試劑盒
值得一提的是，貝瑞基因「同時檢測先天性腎上腺皮質增生症（CAH）相關9個基因多種突變的引物組和試劑盒」（專利種類：發明專利；專利號：ZL 2021 1 1118646.6）、「用於檢測 SMA 中多種突變的引物組、試劑盒、方法和系統」（專利種類：發明專利；專利號：ZL 2022 1 0234941.6）已雙雙取得發明專利證書。
貝瑞基因董事長、總經理高揚表示：「三代檢測產品相繼落地只是一個開始，未來三代測序儀在探尋基因疾病以及人類全基因數據讀取方面，有巨大潛力和廣闊應用空間。貝瑞基因也將繼續瞄準國家重點防控的單基因遺傳病，基於三代測序平台，依託數字生命產業園，為臨床帶來更多創新的檢測方法。」