PCR溫控技術經過三十多年的發展,被廣泛應用於分子生物學的各個領域,普通定性PCR在基礎研究中仍舊是不可或缺的環節。今天我們就來聊一聊PCR溫控儀最為實驗人員關注的溫控性能和常見問題。
PCR溫控儀微流控晶片專家 - 蘇州汶顥微流控技術股份有限公司性能解讀
對普通PCR儀來說,溫度控制指標主要是指溫度的準確性、均一性、以及升降溫速度。
溫度的準確性是指樣品孔溫度與設定溫度的一致性,它直接關係到實驗的成敗。如果排除樣品加入過程中的失誤操作問題,對於PCR反應而言最重要的莫過於溫度控制的準確性。
溫度的均一性是指樣品孔間的溫度差異,它關係到在不同樣品孔進行反應結果的一致性。
升降溫的速度是指在PCR不同反應階段溫度升降的速度。顯然,更快的升降溫速度,可以縮短反應所需的時間,而且有效降低由於升降溫過程產生的非特異性結合、縮短了反應的時間,能提高PCR反應的特異性。
但是,值得注意得是儀器的升降溫速度和樣品管中的樣品的升降溫速度並非同一回事,因為樣品管與基座接觸的緊密性、導熱性、鄰近樣品管的相互影響都會影響樣品的實際升降溫速度。
PCR實驗常見問題及解決方法
1. 陰性對照和陽性對照都出現陽性擴增帶
原因
①陰性樣品和PCR 反應試驗污染。
②電泳上樣時避免PCR 產物漂移到其他孔而影響結果判定。
解決方法
①更換全部試劑,必要時更換所有移液器。
②應小心操作,或瓊脂糖凝膠加厚,增加每孔的容量,可避免加樣液的溢出。
2. 陽性對照呈陰性
原因
①陽性樣品或加入陽性模板失效。無論是組織還是血清,凍融1 次後病原數量明顯減少。
②加入試劑量不準確或遺忘了某一成分。
解決方法
①將陽性對照樣品分成小包裝。每個包裝夠用1 次zui好。
②仔細核對試驗記錄,校對移液器。
3. 出現非特異擴增帶
原因
①樣品模板量過多。
②引物或TaqDNA 聚合酶多。
③鎂離子濃度過高或退火溫度過低。
解決方法:
依據具體實驗的情況,分析上述可能出現的原因,採取相應的措施。
4. 陽性對照擴增帶弱
原因
①電泳時瓊脂糖中EB含量少或長時間後再用已失效。
②擴增效率不高。
解決方法
①是將瓊脂糖凝膠放入含有EB 電泳液中再染30 min 後再觀察。
②檢測儀器是否正常工作。
③增加純化DNA 或cDNA 樣品的稀釋倍數。
擴增效率不高的原因
a.反應體系問題,操作中加入緩衝液、TaqDNA 聚合酶、引物等不準確,造成不能達到zui佳反應體系。
b.儀器不能正常工作。
c.樣品處理過程中殘留有較多PCR 反應抑制物造成的。多數情況是由於操作者怕PCR 不出陽性,有意無意提高PCR 檢測樣品量造成的。
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