看過小說和電影的人都知道，霍格沃茨魔法學校是很難在不被發現的情況下進出的，就算是巫師也不能使用幻影顯形(瞬間移動)進入城堡，也不能通過飛路粉傳送進入，而想要徒步進出的人必須勇敢地面對魔法障礙、致命的生物，或者還有隨時都準備找事的阿格斯·費爾奇。儘管如此，在整個系列中，總是善於違規的哈利、羅恩和赫敏還是發現了幾條通往學校內外的秘密通道。
霍格沃茨有七條已知的秘密通道，應該說弗雷德和喬治韋斯萊是第一個向黃金三人透露這些的人，他們把活點地圖給了哈利，並說明地圖上有七個秘密出口。但地圖對於秘密通道的展示其實並不是完整的，實際上有更多的通道在《阿茲卡班的囚徒》之後的小說中還有說明。這些通道的危險程度各不相同，從危險到瘋狂，都是該系列充滿創意的很好體現，也是魔法主題的完美補充。
獨眼女巫通道(通往蜂蜜公爵)
獨眼女巫的通道就霍格沃茨的秘密通道而言，是比較安全的一條，從三樓走廊上的一尊雕像後面一直延伸到蜂蜜公爵糖果店的地窖里。哈利在《阿茲卡班的囚徒》中多次使用「分離」的咒語打開通道，藉此可以跑到附近的霍格莫德鎮，所以哈利需要這條通道溜到那裡和羅恩、赫敏碰頭。
雖然表面上看，這個通道只是打開了一個「新世界」之門而已，但實際上在第三部小說和電影中它起了關鍵作用。如果沒有它，哈利就不會在三把掃帚酒吧偷聽麥格、弗立維和康奈利·福吉之間的對話，在那裡他知道小天狼星布萊克是他的教父，而且錯誤地認為小天狼星背叛了他的父母，這一情節開啟了哈利在後面與小天狼星的對抗。
鏡子通道(通往霍格莫德)
這條通道藏在霍格沃茨四樓的一面鏡子後面，弗雷德和喬治在他們小的時候，就曾多次使用這條通道進入霍格莫德鎮。小天狼星上學的時候也知道這一點，在第五本小說中，他曾建議鄧布利多軍在那裡開會。
然而，這條通道在哈利讀二年級的時候就塌陷了，到第五年的時候就徹底不能用了。目前還不清楚是什麼原因導致了坍塌，但很有可能與弗雷德和喬治有關。
馬屁精格雷戈里雕像(通向霍格莫德某處)
在《魔法石》中，弗雷德和喬治聲稱他們在霍格沃茨的第一個星期就發現了這個通道，這確實證明了他們製造問題的能力。這條通道隱藏在著名魔藥製造者格雷戈里的雕像後面。他發明了格雷戈里的油膏，這種藥膏可以讓人相信給他們藥膏的人是他們最好的朋友。
這個通道在這個系列中好像並不是很重要，也不清楚它具體到底通向哪裡，只知道是在霍格莫德的某個地方。遊戲玩家曾在幾個《哈利波特》的遊戲中發現過這個通道的存在。
打人柳的通道(通往尖叫棚屋)
打人柳下面的秘密通道在故事中扮演著關鍵角色，它無疑是進出霍格沃茨最致命的通道之一。首先哈利和羅恩在《密室》就領教了這棵樹的危險性，因為它撞壞了阿瑟的飛行汽車。在粗獷的柳樹枝條的保護下，這條通道通向霍格莫德外的一座廢棄之地——尖叫棚屋。
這棵柳樹是用來掩蓋通道的，它在靠近底部的地方有一個小結疤，如同一個按鈕可以防止打人柳的攻擊。年輕的萊姆斯·盧平在《阿茲卡班的囚徒》中變身狼人時，就是利用這條通道躲進棚屋，而其他掠奪者則使用了阿尼馬格斯的技能來躲避樹的打擊。這段通道成就了是第三部小說的高潮部分，也是斯內普、小天狼星、小矮星彼得和狼人盧平之間決戰的背景。
阿格斯·費爾奇知道的三個不明通道
阿格斯·費爾奇是霍格沃茨的管理員，是違反校規者的克星。他和他的貓洛麗絲夫人經常在學院閒逛，尋找不懷好意的違規學生。他可能也是最了解霍格沃茨秘密通道的人物。在《鳳凰社》中，可以了解到費爾奇至少還知道另外三條秘密通道，而且暗中密切監視著。
費爾奇不遺餘力的制止魔法搗亂，大概是因為他自己不會使用魔法，父母中至少有一位是巫師，但他自己只是個啞炮，一個非魔法的人，出於這個原因，他可能會嫉妒學生和他們的魔法能力。不過，對於一個不會施展魔法的人來說，對霍格沃茨秘密如此了解，還是有些令人吃驚的。
有求必應屋(通往豬頭酒吧)
有求必應屋是霍格沃茨七樓的一個密室，只有當一個人非常需要它的時候，它才會出現，並會根據個人的需要改變。在《鳳凰社》中，這裡是鄧布利多軍的聚集地，鄧布利多自己也提到有一次他需要上廁所時發現了它，在他看來，這是一個滿是廁所的房間。當伏地魔還是學生的時候，他也碰到過這個地方，並且認為只有他知道，所以就把其中一個魂器藏在了那裡。
如果有必要，這個房間也完全可以變成一條通道，它和霍格莫德的豬頭酒吧形成了一條隧道。納威和鄧布利多軍的其他成員從這裡來抵抗控制學校的食死徒。最重要的是，哈利、羅恩和赫敏在霍格沃茨戰役之前通過這條通道進入了城堡。這在主題上也有所呼應，因為阿利安娜在鄧布利多年輕的時候就去世了，她的死促使鄧布利多重新思考自己的人生，成為大家所熟知的睿智的巫師，可以說這條通道是鄧布利多和阿利安娜的靈魂幫助英雄們打開的一條通道。
消失櫃(通往博金-博克商店)
消失櫃是一種神奇的物品，如果配對使用，可以作為兩個地方之間的傳送通道。在《混血王子》中，消失櫃成為了食死徒的通道，從而鑄就了一個悲慘的情節。德拉科·馬爾福修理好消失櫃，導致一幫食死徒得以進入霍格沃茨，結果是鄧布利多和食死徒之間的對抗，最終以校長的死告終。
這是整個系列的一個重要情節點，原著在之前就已經預示過這一點。例如，在《密室》中，哈利不小心走進了博金-博克商店，當盧修斯·馬爾福走進店裡時，哈利藏在一個柜子里，當時他並不知道這就是德拉科後來在《混血王子》中使用的消失櫃。在《鳳凰社》的書中，哈利第一次進入有求必應屋時，也提到了消失櫃。
從故事主題上講，消失櫃隱喻了馬爾福複雜的性格和他分裂的忠誠。畢竟，博金-博克店裡有一個柜子，是黑魔法和馬爾福及食死徒血統的象徵，另一個消失櫃則位於有求必應屋，這裡是鄧布利多軍聚集的場所，象徵著馬爾福與霍格沃茨英雄們的聯繫。在很多方面，這是《混血王子》要表現的核心衝突：馬爾福試圖在他的家族對伏地魔的忠誠與他自己的獨立之間找到平衡點。在上一本書的結尾就能得知，馬爾福並沒有完全落入食死徒的控制之下，這也是英雄們最終能夠取得勝利的主要原因之一。事實上，馬爾福是該系列中最複雜的角色，這也許也解釋了為什麼他在觀眾心目中還是如此受歡迎的原因。