施一公團隊近10年在Nature/Cell/Science等已發表76篇文章

bmc科研 發佈 2024-03-01T12:25:34.208238+00:00

2023年2月17日,西湖大學施一公及張曉峰共同通訊在Nature Communications 在線發表題為「Mechanisms of the RNA helicases DDX42 and DDX46 in human U2 snRNP assembly」的研究論文,該研究揭示了人U2 snRNP 組裝中RNA解旋酶DDX42和DDX46的作用機制。

2023年2月17日,西湖大學施一公及張曉峰共同通訊在Nature Communications 在線發表題為「Mechanisms of the RNA helicases DDX42 and DDX46 in human U2 snRNP assembly」的研究論文,該研究揭示了人U2 snRNP 組裝中RNA解旋酶DDX42和DDX46的作用機制該研究報導了DDX42-SF3b複合物的冷凍電鏡結構和含有DDX42 (DDX42-U2複合物)的17S U2 snRNP的組裝前體。DDX42通過N端序列錨定在SF3B1上,其N-plug占據SF3B1的RNA通路。DDX42與SF3B1的結合模式與DDX46的結合模式有著驚人的相似。

在DDX42-U2複合物中,DDX42的N端仍然錨定在SF3B1上,但解旋酶結構域已被U2 snRNA和TAT-SF1取代。通過體外實驗,作者發現DDX42和DDX46在與SF3b的結合方面是互斥的。SF3B1的癌症驅動突變靶向RNA路徑中直接與DDX42和DDX46相互作用的殘基。這些發現揭示了DDX42和DDX46在17S U2 snRNP組裝中的不同作用,並為SF3B1癌症突變的機制提供了見解。

另外,2023年1月13日,西湖大學施一公、黃高興宇及曾超共同通訊在Current Opinion in Structural Biology 在線發表題為「Structure of the nuclear pore complex goes atomic」的綜述文章,該綜述總結了最近在破譯NPC分子細節方面的進展,這些進展在快速發展的冷凍電鏡技術、X射線晶體學和機器學習支持的結構預測方面得到了極大的進展。最近在冷凍電鏡(cryo-EM)重建、機器學習支持的結構預測和生化重建方面的突破結合起來,以前所未有的精度生成了NPC的分子模型。此外,在細胞冷凍電子斷層掃描(cryo-ET)結構揭示了NPC的實質性結構動力學。這些進步使NPC大的組織原則和職能更加清晰。

2023年1月2日,西湖大學施一公團隊Cell Research(IF=46)在線發表題為「LilrB3 is a putative cell surface receptor of APOE4」的研究論文,該研究表明LilrB3是APOE4的假定細胞表面受體。該研究證明APOE4,而不是APOE2,特異性地與白細胞免疫球蛋白樣受體B3 (LilrB3)相互作用。LilrB3胞外結構域(ECD)的兩個離散免疫球蛋白樣結構域識別APOE4的N端結構域(NTD)上帶正電荷的表面斑塊。該原子結構揭示了兩個APOE4分子如何特異性地與兩個LilrB3分子結合,通過形成異質四聚體複合物將它們的細胞內信號基元靠近。與生化和結構分析一致,APOE4,而不是APOE2,以Lilrb3依賴的方式激活人類小膠質細胞(HMC3)進入促炎狀態。總之,該研究確定LilrB3可能是APOE4的免疫細胞表面受體,而不是APOE2,這可能有助於理解APOE亞型的生物學功能和疾病相關性。

最後,iNature編輯部結合Pubmed及Web of Science發現施一公團隊從2014年到2023年(截至2023年3月23日)在Nature (4篇),Science (14篇),Cell (7篇),Cell Research (9篇),PNAS(15篇),Nature Communications (3篇),Protein Cell (3篇)及CURRENT OPINION IN STRUCTURAL BIOLOGY (5篇)等發表76篇文章(包括綜述及研究論文,通訊作者的有68篇文章)(文章後附列表),專注於剪接複合物,核孔複合物及分泌酶等的結構解析。另外,由於時間匆忙,如有錯誤,可向編輯部反饋。

76篇文章列表如下:

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