2023年2月17日,西湖大學施一公及張曉峰共同通訊在Nature Communications 在線發表題為「Mechanisms of the RNA helicases DDX42 and DDX46 in human U2 snRNP assembly」的研究論文,該研究揭示了人U2 snRNP 組裝中RNA解旋酶DDX42和DDX46的作用機制。該研究報導了DDX42-SF3b複合物的冷凍電鏡結構和含有DDX42 (DDX42-U2複合物)的17S U2 snRNP的組裝前體。DDX42通過N端序列錨定在SF3B1上,其N-plug占據SF3B1的RNA通路。DDX42與SF3B1的結合模式與DDX46的結合模式有著驚人的相似。
在DDX42-U2複合物中,DDX42的N端仍然錨定在SF3B1上,但解旋酶結構域已被U2 snRNA和TAT-SF1取代。通過體外實驗,作者發現DDX42和DDX46在與SF3b的結合方面是互斥的。SF3B1的癌症驅動突變靶向RNA路徑中直接與DDX42和DDX46相互作用的殘基。這些發現揭示了DDX42和DDX46在17S U2 snRNP組裝中的不同作用,並為SF3B1癌症突變的機制提供了見解。
另外,2023年1月13日,西湖大學施一公、黃高興宇及曾超共同通訊在Current Opinion in Structural Biology 在線發表題為「Structure of the nuclear pore complex goes atomic」的綜述文章,該綜述總結了最近在破譯NPC分子細節方面的進展,這些進展在快速發展的冷凍電鏡技術、X射線晶體學和機器學習支持的結構預測方面得到了極大的進展。最近在冷凍電鏡(cryo-EM)重建、機器學習支持的結構預測和生化重建方面的突破結合起來,以前所未有的精度生成了NPC的分子模型。此外,在細胞冷凍電子斷層掃描(cryo-ET)結構揭示了NPC的實質性結構動力學。這些進步使NPC大的組織原則和職能更加清晰。
2023年1月2日,西湖大學施一公團隊在Cell Research(IF=46)在線發表題為「LilrB3 is a putative cell surface receptor of APOE4」的研究論文,該研究表明LilrB3是APOE4的假定細胞表面受體。該研究證明APOE4,而不是APOE2,特異性地與白細胞免疫球蛋白樣受體B3 (LilrB3)相互作用。LilrB3胞外結構域(ECD)的兩個離散免疫球蛋白樣結構域識別APOE4的N端結構域(NTD)上帶正電荷的表面斑塊。該原子結構揭示了兩個APOE4分子如何特異性地與兩個LilrB3分子結合,通過形成異質四聚體複合物將它們的細胞內信號基元靠近。與生化和結構分析一致,APOE4,而不是APOE2,以Lilrb3依賴的方式激活人類小膠質細胞(HMC3)進入促炎狀態。總之,該研究確定LilrB3可能是APOE4的免疫細胞表面受體,而不是APOE2,這可能有助於理解APOE亞型的生物學功能和疾病相關性。
最後,iNature編輯部結合Pubmed及Web of Science發現施一公團隊從2014年到2023年(截至2023年3月23日)在Nature (4篇),Science (14篇),Cell (7篇),Cell Research (9篇),PNAS(15篇),Nature Communications (3篇),Protein Cell (3篇)及CURRENT OPINION IN STRUCTURAL BIOLOGY (5篇)等發表76篇文章(包括綜述及研究論文,通訊作者的有68篇文章)(文章後附列表),專注於剪接複合物,核孔複合物及分泌酶等的結構解析。另外,由於時間匆忙,如有錯誤,可向編輯部反饋。
76篇文章列表如下: