生物醫學大數據往往規模宏大、內容複雜，存儲、管理、處理和有效挖掘這些數據讓不少科研人員感到頭疼。近日，廣州國家實驗室研究員李亦學接受南方+採訪時介紹，由廣州國家實驗室牽頭、北京火山引擎科技有限公司參與研發的生物醫學大數據作業系統「Bio-OS」，能夠幫助科研人員生成標準化、易使用、易獲取的科研分析平台，降低其處理海量數據的複雜度。
工作流管理、人機互動、硬體資源管理、AI大模型……在李亦學的設想中集結了多項智能工具的Bio-OS，有望像「安卓系統」一樣，通過開源實現蓬勃發展，改變生物醫學科研工作的生態。
「藉助作業系統，生物醫學方向的科研人員只需專注於自己擅長領域，不必過多地聚焦於計算機技術和計算方法。」 李亦學說，科研人員藉助該作業系統，能快速完成實驗數據計算工作，讓科學發現更快「浮出水面」。
Bio-OS包含了豐富的應用體系，能夠滿足大部分生物醫學大數據存儲、分析需求。例如，該作業系統的分布式組網可以形成智能化的資源匯聚、算力支撐和數據分析挖掘體系，為搭建疾病檢測、監測、預測、預警網絡等方面提供技術支撐。
李亦學透露，團隊正與廣州醫科大學附屬第一醫院、廣東省人民醫院、中山大學附屬第六醫院等醫療機構合作，在呼吸系統疾病、腫瘤多組學分析方向上開展工作。
目前，該作業系統已連通國際主流開源社區，接入50萬餘全球全基因組數據集，沉澱了10000多種算子和1400多套工作流，涵蓋了基因組分析、轉錄組分析、單細胞與空間轉錄組分析、代謝與蛋白質組分析、病原與微生物應用、AI相關應用等，為科研人員提供一站式開箱即用的分析資源。
「該作業系統在醫療機構、科研單位、高校和企業中具備廣泛應用前景，能加速我國生物醫學數據密集型科研發展。」李亦學表示，團隊目前已與中國科學院上海營養與健康研究所、中山大學生物醫學實驗室、上海復旦大學表型組研究院等多家科研院所和醫療機構達成合作意向。
南方+記者 吳雅楠 鍾哲
【作者】 吳雅楠；鍾哲
廣東科技頭條