一直被忽視的蛋白質,蘊藏著巨大的潛能

原理 發佈 2024-05-01T05:51:21.018989+00:00

比如,在我們的細胞和組織中東奔西跑的數以百萬計的信號分子、激素和其他生物分子,在許多關鍵過程中都發揮著主導作用。


所有生物學家都知道,不起眼的結構有時可以帶來巨大的影響。比如,在我們的細胞和組織中東奔西跑的數以百萬計的信號分子、激素和其他生物分子,在許多關鍵過程中都發揮著主導作用。

儘管生物學家和醫學家將這些知識熟記於心,但長期以來,他們卻忽視了一類特殊的蛋白質。因為這些蛋白質非常小,而且只在靈長類動物中被發現了,所以科學家認為這些蛋白質是無足輕重,不具備任何功能的。

但幾年前的一些發現顛覆了這種觀點。科學家發現,人體器官中存在成千上萬種新型微蛋白

近日,在發表在《分子細胞》上的一篇新論文中,一組國際研究團隊描述了他們如何系統地研究這些微蛋白,以及從中了解到的情況,比如這些蛋白質在哪些基因組序列中被編碼,在它們進化過程中何時發生DNA突變。他們懷疑,與長期以來的假設相反,這些微蛋白在各種細胞功能中發揮著關鍵作用


迄今為止最小的蛋白質

生物信息學基因分析顯示,大多數人類微蛋白在進化過程中的發展,比目前科學家所知道的大型蛋白質晚了數百萬年。由於相對快速的「創新和適應」,這些年輕的蛋白質也可能在很大程度上參與了進化的發展,進化過程本身也有可能比以前認為的更加動態。

與我們基因組中編碼的已知古老蛋白質不同,大多數微蛋白在某種程度上可以說是「憑空出現」的。換句話說,它們是從先前不負責生產蛋白質的DNA區域中出現的。

微蛋白沒有採取更簡單的「常規」路徑從現有版本中複製和衍生。而且,這些小型蛋白質僅僅在人類進化過程中出現,在其他大多數動物的細胞中都沒有。但在小鼠、魚類和鳥類這些動物身上,科學家已經發現了屬於它們自己的年輕的小型蛋白質集合。

線粒體(綠色)和細胞核(藍色)中的微蛋白在人類細胞中被過度表達。黃色和粉色的區域顯示,微蛋白的信號與線粒體和核的信號重疊。(圖/Clara-Louisa Sandmann, Max Delbrück Center)


然而,這種巨大的年齡差距似乎並不妨礙這些蛋白質之間的「對話」。研究人員使用馬克斯·德爾布呂克中心在2017年開發的生物技術篩選方法,驚訝地發現,年輕得多的微蛋白實際上可以與古老得多的蛋白質相互作用

團隊在一張膜上合成了微蛋白,然後用含有人類細胞中已知的大多數蛋白質的溶液進行「孵化」。複雜的實驗和計算機輔助分析,讓研究人員能夠確定單個結合對。

如果一種微蛋白與另一種蛋白結合,並不一定意味著它會影響另一種蛋白的工作,或是影響這種蛋白質所參與的某些過程。但結合的能力確實表明,這些蛋白質可能會影響彼此的功能。實驗證實了這一假設,這讓研究人員有理由認為,微蛋白可能會影響比它們早幾百萬年的細胞過程,因為一些古老的蛋白質在最早期的生命形式中就存在。

與此同時,研究人員還留意到了迄今為止發現的最小的人類蛋白質。他們確認了200多種超小型蛋白質,每種都不到16個胺基酸,或者可以理解成不足16個「單位」。作為對比,通常情況下,蛋白質都由幾百個胺基酸構成。

這就提出了一個問題——一種蛋白質最小能多小?又或者說,蛋白質必須有多大才能發揮作用?

一些已知的小型蛋白質被稱為肽,具有作為激素或者信號分子的功能。它們是從較大的前體蛋白質中分離而來的。而現在的研究表明,相似大小的肽也能以截然不同的方式發展而來

這些最小的蛋白質同樣可以非常明確地專門與更大的蛋白質結合。但目前我們仍不清楚它們能否成為激素或者類似的東西。


微蛋白的作用

科學家表示,顯而易見的是,微蛋白太重要了,人們不能一直忽視它們。

研究人員也還不知道這些微蛋白在我們的身體中的主要作用。但這項研究確實提供了一種關於這些分子能力的暗示。一種可以想見的情況是,這些微蛋白可能參與了心血管疾病和癌症過程,因此可以作為診斷和治療的新目標。

他們的研究已經調查了281種微蛋白,但未來的目標是擴大實驗範圍,包括最近編錄的7000種微蛋白中的更多種類,揭示許多尚未發現的功能。



參考來源:

https://www.mdc-berlin.de/news/press/evolution-miniproteins-appeared-nowhere

封面圖&首圖:Clara-Louisa Sandmann, Max Delbrück Center

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