背景調查的合理性就在於員工的配合。調查員工背景最怕的就是企業沒能與員工團結協作，相互配合，產生各種糾紛。企業要調查員工背景，到底如何有效避免糾紛產生呢？
一、獲得候選人的支持與理解
糾紛的產生原因就是候選人對於背調的各項工作不滿。企業要調查員工背景獲得員工的支持與理解是必須的。首先向員工說明背調的目的、內容、範圍，對員工疑問之處進行解釋說明，獲得他們的支持。其次，獲取員工背景調查授權書與背景調查信息表，說明雙方的義務、權力、要承擔的責任等。最後，妥善保管相關資料，讓出現問題時有證明材料支撐。
二、在調查中保持客觀態度，保護信息安全
要在調查中保持客觀的態度，給每位求職者公平的求職機會，不因為個人的偏向做出錯誤決定。保持嚴謹態度對待背調結果，處理背調結果，不輕易定性員工。將背調報告作為考察依據而不是決定性工具。妥善保管背調報告，防止個人信息泄露，透露員工隱私。
三、背調出現問題及時關註解決
背景調查的結果中如果顯示出現虛假，企業應當及時地看見並關注，保留書面背調報告，並對可能造成背調出錯的特殊情況進行排除。比如職位不同，有可能是企業對內與對外的說法有差距，比如查不到的學歷信息可能是因為信息時間過早而沒被錄進最新的學歷信息系統。及時對背調報告中出現的疑問之處與候選人核實，及時地聯繫溝通。
背景調查出現糾紛的主要原因就是企業沒有做好與員工的工作配合，或者是沒有處理好各種資料數據。要避免這些糾紛，就要完善背調製度流程、做好溝通解釋工作。