贛深高鐵本身就存在著很多爭議點，在規劃之初，最大的爭議點就是為什麼會出現龍川彎!從最初的規劃線路圖誕生之日起，關於龍川彎產生充斥著各種說法，地質論、陰謀論、經濟論……各種觀點沸沸揚揚。
贛深高鐵對廣東意義重大，粵東北地區人民的希望之路
一直以來，廣東在高鐵建設上的表現一直不積極，贛深高鐵開通之前，廣東出省的高鐵線路時速300km/h以上的只有京廣高鐵，貴廣高鐵也僅按照時速250km運營。
廣東高鐵不光等級低，線路還少，除了以上兩條，就只剩下廣西方向的南廣鐵路，福建方向的沿海鐵路，速度200~250km不等。這與廣東國內第一經濟大省的地位明顯不符合，所以近年來廣東也加強了高鐵方面的規劃建設。
贛深高鐵是京港高鐵的末端，作為高鐵主幹道以及串聯起的城市來看，它絕對是一條不亞於京廣高鐵的主幹線。同時，缺乏高鐵的粵東北地區也會因為贛深高鐵，加強與粵中地區和國內各城市的交流，極大地促進沿線各城市的發展。
龍川彎成為全線走向的最大的爭議
贛深高鐵全線走向最大的爭議點出現在定南與河源之間，也就是我們說的龍川彎。當時規劃之初，出現了3個走向方案，下圖中2號方案就是定南直接拉直連接河源，3號方案繞到興寧，1號方案就是現在贛深高鐵龍川彎方案。
很多人很納悶，龍川就是一個縣，人口也就五十多萬人，為了一個縣放棄線路取直而拐了那麼大一個彎，究竟有什麼意義。況且贛深高鐵造價不低，單公里單價更是目前國內最高，繞行龍川將多出幾十公里里程，需要旅客買單。
一時間各種說法此起彼伏，甚至出現了修鐵路的人是龍川人這種奇葩論點，其實之所以繞行龍川無外乎出於帶動更多城市和凸顯龍川粵東北高鐵樞紐地位考慮。
廣東有意打造龍川高鐵樞紐地位
雖然貴為國內第一經濟大省，但粵東和粵西相比粵中地區發展其實相對落後，有點類似於蘇北與蘇南地區。
前面提到，廣東的高鐵建設相對於其它省份可以用發展落後來形容，粵東北地區更是如此，贛深高鐵開通運營前，該地區甚至沒有一條高鐵線路。
與福建共同規劃龍龍高鐵，目的就是讓梅州與河源連接，此後韶關與龍川的高鐵也提上日程，顯然廣東有意讓龍川發揮高鐵樞紐作用，如果線路取直，梅州至龍川高鐵就需要延長至河源，里程約幾十公里，這樣也會產生幾十億的投資。
還有一點，線路繞行後能帶動河源市更多的縣城，輻射能力更強，進而帶動粵東北地區更多的城市。目前高鐵建設採取國鐵集團和地方政府共同投資的模式，地方投資比例也較大，所以線路走向要參考地方建議，再者高鐵不是一味的拉直，還要考慮帶動沿線城市發展。所以在龍川、河源、廣東省爭取下，最終線路採納了繞行龍川的方案。
贛深高鐵開通運營後，新的爭議出現
2021年12月，贛深高鐵在廣東、江西兩省人民的關注下開通運營，但隨之也產生了新的爭議。
由於贛深高鐵橋隧比過高，造成單公里造價偏高，隨之而來的便是贛深高鐵單公里票價創下全國紀錄。而這還是以310km運營速度定的票價，如果後期提速至350km，票價將繼續上浮。由於贛深高鐵大部分區域為贛南和粵東欠發達地區，這個票價對沿線旅客可不那麼容易接受。