一、申請途徑
1.直接申請
2.巴黎公約：要求優先權，12個月內在日本遞交；可以用中文或英文說明書遞交新申請，自優先權日起16個月補交日文譯文
3.PCT進入日本：優先權日起30個月進入；可以用中文或英文說明書遞交新申請，然後在遞交日起2個月內補交日文譯文。
二、日本發明專利的申請流程
1. 受理和形式審查
日本特許廳對申請文件進行初步審查，如果文件沒有問題則會發出受理通知書；
遞交文件存在缺陷時，官方會下發補正通知書，要求在發文日起2個月內補正。
2. 公開
自申請日起(要求優先權的自優先權日起)18個月，申請內容將被公開。可以要求提前公開。
3. 實質審查請求
申請日起三年內，任何人（申請人或第三人）可就該申請提出實質審查請求。在沒有提出實質審查請求之前日本特許廳不會對發明專利進行審查，期滿未提實審請求的，申請被視為撤回。
4. 實質審查
依照申請人提出的實質審查請求，JPO對發明專利申請的可專利性進行實質審查。JPO認為該申請具有可專利性時，將直接授予專利權；認為該申請存在不能授權的缺陷時，將發出拒絕理由通知(Notice of Reasons for for Rejection)，即審查意見通知書。針對該拒絕理由通知，申請人可以進行答辯和/或修改。答覆期限為發文日起三個月，最多可以延期三個月（2+1模式或者1+1+1）。JPO認為申請人提交的答辯和/或修改克服了拒絕理由通知且不存在其他拒絕理由時，將發出授權通知書。JPO認為申請人提交的答辯和/或修改仍然沒有克服拒絕理由通知的，將發出駁回決定(Decision of Rejection)。收到駁回決定後，可以在4個月內提出覆審請求。提覆審時可以提出分案申請。
5. 授權
如果審查員發現在審查階段沒有不予授予專利的情況，則直接下發授權通知；在評估申請人提交的答辯和/或修改後，沒有不予授予專利的情況，則發出授權通知。授權通知發文日起一個月內繳納登記費。
6. 年費
從申請日或者PCT申請日起保護20年，年費從授權日起算，含首3年年費。
日本發明專利的審查周期大概為2年左右，為了加速專利審查、縮短專利授予的周期，目前有三種常見的加快審查途徑：
1. 早期審查
根據日本特許廳公布的《特許出願の早期審査•早期審理ガイドライン 平成２８年８月》，當專利申請滿足以下任意一個條件時，即可請求JPO對該專利申請進行早期審查：
（1）已經實際製造、銷售了專利產品，或從申請加快日開始2年內計劃生產該專利產品（包括已經申報農藥或藥品的審批的情況）；
（2）申請人就該發明已經向其它國家的專利局提出了專利申請，或者已經提出了國際申請；
（3）該申請的申請人中全部或部分是中小企業、科研院所、個人、公益機構；
（4）該申請涉及綠色節能技術；
（5）來自大地震震災區的申請；
（6）在亞洲有關聯公司的跨國集團的相關申請。
對於中國申請人，可以利用上述的第二個條件提出早期審查請求，但是對於從中國到日本的申請來說，如果在國內沒有申請，直接去日本申請且不屬於PCT申請的話，則不能利用該條。
通過早期審查程序可以大大縮短審查時間，加快審查進程。一般情況下，通過早期審查程序，收到第一次審查結果報告的時間比正常情況下平均可以縮短6個月左右，在早期審查程序中收到第一次審查意見通知書的時間平均為2.3個月。需要說明的是，向JPO提出早期審查請求時無需繳納官費，並且早期審查請求可以在提交審查請求的同時或者之後提出。
2. 超早期審查程序
超早期審查除了要滿足前述的早期審查程序的條件外，還需要滿足以下條件：
（1）相關聯的專利申請已在國外提出；
（2）申請超早期審查至少4周前已在線完成所有申請程序；
（3）相關聯的專利申請的技術方案得以實施。
超早期審查的申請程序大致和早期審查的申請程序相同，唯一不同之處在於，需要在「情況說明書」中註明該申請請求進行超早期審查。超早期審查可以進一步加速審查進程，大約平均在一個月左右就會收到第一次審查意見通知書。
3. PPH
除了上述的加速審查途徑，日本還與多個國家或地區的專利審查機構建立專利審查高速公路PPH。以中國專利局（CNIPA）和日本特許廳之間的中日專利審查高速路為例，申請人可以：（I）使用來自CNIPA 的工作結果；以及（II）使用來自CNIPA 的PCT 國際階段工作結果來提出PPH請求。
第（I）種情況下，該日本申請需滿足以下條件：
（1）該日本申請（包括PCT 國家階段申請）是依巴黎公約有效要求CNIPA 申請優先權的申請，或未要求優先權的PCT 國家階段申請，或依巴黎公約有效要求PCT 申請優先權的申請，該PCT申請未要求優先權。
有效要求多個CNIPA 申請或直接PCT 申請優先權的申請，或符合以上要求之原始申請的分案申請，亦符合要求；
（2）在CNIPA 至少有一個對應申請，其具有一項或多項被CNIPA認定為具有可專利性/可授權的權利要求；
（3）JPO 申請的所有權利要求必須與CNIPA 認定為具有可專利性/可授權的一個或多個權利要求充分對應；
（4）JPO 在申請人提出PPH 請求之時尚未對申請進行審查。
第（II）種情況下，該日本申請需滿足以下條件：
（1）對應該申請的PCT 申請的國際階段的最新工作結果（例如國際初步審查報告，國際檢索單位的書面意見等）指出至少一項權利要求具有可專利性/可授權；
（2）申請和對應國際申請之間的關係滿足以下要求之一：
a.申請是對應國際申請的國家階段申請
b.申請是作為對應國際申請的優先權要求基礎的國家申請
c.申請是要求了對應國際申請的優先權的國際申請的國家階段申請
d.申請是要求了對應國際申請的國外/國內優先權的國家申請
e.申請是滿足以上(A)-(D)要求之一的申請的派生申請（分案申請和要求國內優先權的申請等）；
（3）提交進行PCT-PPH 審查的申請的所有權利要求，無論是原始提交的或者是修改後的，必須與對應國際申請中被最新國際工作結果認為具有可專利性/可授權的一個或多個權利要求充分對應；
（4）JPO 在申請人提出PPH 請求之時尚未對申請進行審查。
需要注意的是，不論使用來自CNIPA的工作結果還是使用來自CNIPA 的PCT國際階段工作結果來提出PPH請求，該日本申請的權利要求必須全部被CNIPA認為是可授權的，才能根據來自CNIPA的工作結果來提出PPH請求。
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