19世紀，達爾文的進化論學說橫空出世，風靡全球。但隨著時間的發展和新證據的出現，產生了越來越多的質疑。曾作為進化論最重要證據之一的海克爾胚胎重演律，竟是一場驚天騙局，被視為科學界的恥辱。
胚胎重演律認為動物胚胎在發育過程中經歷的階段是該物種過去進化形式重演。比如人的胚胎在第四周所有會發育出所謂的「腮縫」，這是人類魚祖先時期的證明。海克爾用圖片的形式來展示，不同的物種在胚胎的最早期階段幾乎完全相同，，從而證明所有的物種都具有共同的祖先。
但當一些科學家想重現海克爾的胚胎演化階段時，卻發現與海克爾的結論有天壤之別。在人類胚胎的發育過程中並沒有發現魚的階段。並且對比不同動物胚胎的生長過程，其相似性並不算高。
1997年，《解剖與胚胎學》學報揭露了海克爾的騙局，原來他故意選擇較相近的胚胎，並且加了一些「小手段」。比如把雞胚胎的眼睛塗上顏色，把人胚胎的手腳胚芽去掉，再加上長脊椎假裝尾巴，並隨意更改胚胎的大小比例等。在這之前，許多教科書還引用了海克爾的理論，可見造假行為給科學界帶來的損失之巨大。也有人調侃，海克爾是被生物學耽誤了的大畫家。
實際上，進化論並不是一個被完整證實的科學理論，它仍然以假說的形式存在，仍有著許多的矛盾，並且存在證據嚴重不足的問題。
例如從人類的進化史來看「物競天擇，適者生存」。大家常說兩條腿的跑不過四條腿的。相比於猿猴，人類直立行走會減小奔跑速度，人類的體毛變少不利於保暖，皮膚變薄更容易受傷，牙齒變短不利於攻擊。在原始複雜的生存環境中，似乎是人往猿猴方向進化才更容易生存下去。
第二，如果物種是慢慢進化而來，那過渡物種的數量勢必會遠大於現有的物種數量。比如進化到長頸鹿的漫長過程中，會有產生許多過渡鹿，他們的脖子越來越長，並且過渡鹿的數量應遠多於長頸鹿的數量。但是已發現的化石中，只有成型的長頸鹿，並沒有發現「過渡鹿」。現在已知的生物化石有幾百萬種，那過度化石至少要達到千萬種才顯得合理。但如今被發現的疑似「過渡型化石」僅有一千多種，現狀與進化論確實相悖。
第三，無數發現和證據表明，物種是在短時間內，爆發式形成的，而不是漫長的進化形成的。品種的變化和新物種的產生完全不能一概而論。不同品種的狗雜交，不管經過怎樣的變異，其後代始終都是狗。人類把許多植物的種子帶入太空，來提升種子基因突變的可能性，也就是太空育種。即使是太空與地球這樣大的環境差異造成的突變，所有的種子培育出來的仍然是之前的物種，只是產生了新的品種，並沒有產生任何新的物種，青椒還是青椒，胡蘿蔔還是胡蘿蔔。
牛頓認為， 地球由於所謂第一推動力而運轉起來，以後就不停地運動下去，生物物種也是這樣。我們知道，一個正確的理論，從不同的方面都能證明其正確性，並且新的發現和新的證據會對其進行補充。比如愛因斯坦的相對論，從最初的沒有人看懂，到後來可以在實踐中的運用就是如此。而進化論卻反而與許多成熟的理論之間存在著明顯的矛盾和對立。如果把進化論當做一個正確的理論來學習，確實有失科學的嚴謹性。
那麼宇宙究竟是怎樣產生的？人類又是怎麼來的？起源問題至今還沒有令人信服的科學回答。或許第一個人比我們更加了解自己的由來。已知的記載中，最早的是《創世紀》的神創論。神創論確實解釋的通這一切的問題，而且也確實沒有證據來表明神創論的錯誤。西方諺語常說，科學的盡頭是神學。那上帝又是怎麼來的？
《聖經》記載，上帝是自有永有的，是起初，然後創造萬物。這讓我們很難想像。但我們身邊的空氣、水、石頭乃至這個世界是真實存在的，總有一種東西是最先生成了自己。如果不是被創造，那麼是水自己生成了自己，空氣自己生成了自己嗎？我們看到一塊石頭，想像是石頭自己生成了自己嗎？如果簡單概括為自然形成，為什麼「自然」把一切規律計算的如此精準，是「自然」自己生成了自己嗎？那麼所謂的「自然」又是誰？
疑問不間斷，探索也不會停止，總有一天，真相會被所有人看到。