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小夥伴們，大家好呀，很高興和大家見面，最近看到有果粉提問關於WGCNA分析中的POWER圖譜的問題，之前呢有寫過關於WGCNA分析中的一些專業術語基礎知識的推文，如果有小夥伴需要，可直接在往期裡面查找就可以了，今天呢我們來聊聊關於如何進行power讀圖。內容分為兩部分，
一是介紹什麼是power，
二是power圖解讀。
走神的，還沒有準備好的小夥伴快來看這吧。
一、介紹power
Power：這個是軟閾值，是根據 pickSoftThreshold函數計算出來的。在統計中它是一個檢驗研究工作有效性的指標，Power越大，研究結果越可靠。在此處是反應相關性數值是否或者接近無標度網絡特徵，具有重大的生物意義。
二、解讀power圖譜
首先power圖譜是像上圖這樣的。其中的左圖為尺度獨立性，右圖為鄰接均值。power值的確定就是根據這兩個圖進行確定的，二者缺一不可。
上圖所示的左右兩個圖譜的橫軸均代表權重參數即軟閾值，左圖縱軸Scale Free Topology Model Fit，即 signed R^2，是對應的網絡中log(k)與log(p(k))相關係數的平方R^2。WGCNA包中的推薦的最佳power值為20，根據左圖中的紅線位置，確定power閾值選為20，即此時的左圖的縱坐標 R^2 在0.85左右，說明該網絡越逼近無尺度分布。相關係數的平方越高，說明該網絡越逼近無網路尺度的分布。
右圖的縱軸代表對應的基因模塊中所有基因鄰接函數的均值。當右圖中橫坐標中的power閾值選為20時，鄰接函數的均值也逐漸接近於0，呈現出平緩的趨勢。
到這裡呢，小果的分享就到此結束了，小夥伴有什麼問題可以私信小果，小果定會及時回復的，期待與小夥伴再會。
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