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作者：Cathy
導言：胃癌是源自胃黏膜上皮的惡性腫瘤，在我國各種惡性腫瘤中發病率居首位。由於飲食結構改變、工作壓力增大等原因，使得胃癌的發病呈現年輕化趨勢。早期胃癌常常無症狀或僅有輕微症狀，當臨床症狀明顯時，病變已屬晚期，給治療帶來了很大困難。近日，俄羅斯的研究人員首次開發了一種基於RNA測序的個性化胃癌治療技術。
免疫治療是目前胃癌的最新治療手段，然而，患者對治療的反應往往是不可預測的，因此需要針對具體情況制定個性化療法和藥物處方。近日，莫斯科物理技術學院（MIPT）的研究人員首次開發了一種基於腫瘤細胞RNA測序的個性化胃癌治療技術，給胃癌的治療帶來了新的思路。
這項研究由莫斯科物理技術學院轉化基因組生物信息學實驗室高級研究員Maxim Sorokin領導，並在俄羅斯科學基金會的支持下發表在《冷泉港分子案例研究》上。題目為「RNA sequencing profiles and diagnostic signatures linked with response to ramucirumab in gastric cancer」
胃癌的相關死亡率在所有癌症中排名第五。由於早期診斷的比例很低，大多數患者被診斷出來時就已經為晚期。對於HER2陽性病例，一線治療標準包括氟嘧啶和鉑類化合物配合曲妥珠單抗。對於復發性胃癌，有幾種替代選擇，包括雷米庫單抗，一種單克隆治療性抗體，可通過與VEGFR2結合，單獨或與其他癌症藥物配合來抑制VEGF介導的腫瘤血管生成。然而，雷米庫單抗或其混合體的總反應率占患者總數的30％–80％，這表明胃癌的治療需要個性化藥物處方以提高治療效果。
MIPT的生物信息學家研究了15位胃癌晚期患者的原始腫瘤RNA測序情況，以及對雷米庫單抗或其混合體的臨床反應。結果顯示，有三個基因在腫瘤中顯示出不同程度的表達：CHRM3，LRFN1和TEX15。其中，CHRM3的表達在反應中上調。研究人員使用生物信息平台Oncobox，模擬了雷米庫單抗的效率，並將輸出模型結果與實際的腫瘤反應數據進行了比較。結果發現，預測的臨床結果與實際的臨床結果一致（AUC≥0.7）。這些結果表明，RNA測序可用於篩選雷米庫單抗治療胃癌的個性化處方，並揭示了雷米庫單抗耐藥性的潛在分子機制。
用治療性抗體治療胃部的復發性腫瘤，它們阻斷負責接收促進生長信號的細胞表面受體。沒有它們，細胞分裂就會停止，腫瘤的大小不會增加。在癌症治療中，阻止血管的生長特別重要，因為血管為腫瘤提供了營養和氧氣。雷米庫單抗是一種治療性抗體，用於破壞腫瘤組織中血管的生長。但該藥物的功效因人而異。
此前，MIPT的生物信息學家以及醫學研究中心和行業內專家建議，可以將患者有關癌症基因表達水平的數據，用於評估不同情況下的雷米庫單抗的療效。
該研究的第一作者，MIPT轉化基因組生物信息學實驗室高級研究員和Oncobox生物信息學系主任Maxim Sorokin說：「這次研究實際上是第一個成功為胃癌患者開出[雷米庫]處方的病例，這不是隨機的，而是通過我們基於RNA測序追蹤的分子標記分析得出的信息。」
結合信息技術，現代分子生物學方法使研究人員能夠收集細胞中每個基因表達的定性數據。通過分析這些數據，可以找到診斷腫瘤疾病和預測其治療效果的關鍵。
參考：
【1】Maxim Sorokin et al. RNA sequencing profiles and diagnostic signatures linked with response to ramucirumab in gastric cancer, Molecular Case Studies (2020). DOI: 10.1101/mcs.a004945
【2】https://medicalxpress.com/news/2020-06-bioinformaticians-personalize-drug-prescription-stomach.html
【3】http://molecularcasestudies.cshlp.org/content/6/2/a004945
【4】https://baike.so.com/doc/5332305-5567671.html