會澤一詞，含義豐富，有三種說法。一說，會、惠相通，為惠澤於民之意。一說，是因境內小江，金沙江、牛欄江數水交匯而得名，詞意本身就有匯集百川，澤潤天下之意。「治滇有善政、護國立奇功」的近代名人唐繼堯創立的雲南第一所現代高等學府—東陸大學（今雲南大學），就以「會澤百家、至公天下」作為校訓沿用至今。一說，是因會澤的地理位置位於「會川都督府以東（東川），府治臨澤」得名。
會澤，至今有2000多年歷史，是雲南最早設置郡縣的四個地區之一。
會澤開發墾殖甚早，《華陽國志·蜀志》說，秦、漢修「五尺道」和南夷道，都以焚道為起點，向南延伸，從會無縣渡瀘得堂狼（即會澤縣）。
西漢建元六年（公元前135年）置堂琅縣，屬犍為郡，東漢屬犍為國都尉，三國蜀漢為堂琅縣，分犍為立朱提郡（一說，漢武帝建元六年（前135）為三絳縣，東漢永初元年（107）為堂琅縣）。隋朝屬恭州地。唐武德四年（621）改為唐興縣，唐咸通年間為南詔國東川郡。宋大理段氏設東川大都督，後為烏蠻閟畔部，元初置閟畔萬戶府，至元十五年（1278）改閟畔軍民總管府，二十八年（1291）立東川路，明洪武十四年（1381）開置東川土府，隸雲南布政使司，十六年（1383）改隸四川，為東川軍民府。
清順治十六年（1659）稱東川府內附，康熙三十七年（1699）改設流官。康熙三十八年（1699）為東川府。雍正五年（1727）置會澤縣，以征糧不便，東川府又折出四川，改隸雲南布政使司，會澤縣駐巧家，翌年遷到鍾屏。民國二年（1913），裁東川府，改名東川縣，屬雲南滇中道。1929年改名會澤縣（一說為1919年，又一說為1927年），1947年屬曲靖專署。
1949年獲得解放，以後隸屬昭通專區。1954由會澤縣境劃出湯山、因民、新村、布卡等四區成立東川礦區，由省直轄。1958年10月成立東川市，撤會澤縣劃為會澤、迤車、者海、待補四個聯社隸屬東川市（一說為東川市會澤區）。1965年恢復會澤縣，改隸曲靖專區。1970年屬曲靖地區，1997屬曲靖市。