一、構成和修復組織 蛋白質是構成機體組織、器官的重要成分，人體各組織、器官無一不含蛋白質。在人體的瘦組織中，如肌肉組織和心、肝、腎等器官均含有大量蛋白質；骨骼、牙齒、乃至指、趾也含有大量蛋白質；細胞中，除水分外，蛋白質約占細胞內物質的 80％。因此，構成機 體組織、器官的成分是蛋白質最重要的生理功能。身體的生長發育可視為蛋白質的不斷積累 過程。蛋白質對生長發育期的兒童尤為重要。人體內各種組織細胞的蛋白質始終在不斷更新。例如，人血漿蛋白質的半壽期約為 10 天，肝中大部分蛋白質的半壽期為 1～8 天，某些蛋白質的半壽期很短，只有數秒鐘。只有 攝入足夠的蛋白質方能維持組織的更新。身體受傷後也需要蛋白質作為修復材料。
二、調節生理功能
機體生命活動之所以能夠有條不紊的進行，有賴於多種生理活性物質的調節。而蛋白質 在體內是構成多種重要生活性物質的成分，參與調節生理功能。如核蛋白構成細胞核並影 響細胞功能；酶蛋白具有促進食物消化、吸收和利用的作用；免疫蛋白具有維持機體免疫功 能的作用；收縮蛋白，如肌球蛋白具有調節肌肉收縮的功能；血液中的脂蛋白、運鐵蛋白、 視黃醇結合蛋白具有運送營養素的作用；血紅蛋白具有攜帶、運送氧的功能；白蛋白具有調 節滲透壓、維持體液平衡的功能；由蛋白質或蛋白質衍生物構成的某些激素，如垂體激素、 甲狀腺素、胰島素及腎上腺素等等都是機體的重要調節物質。
三、供給能量
蛋白質在體內降解成胺基酸後，經脫氨基作用生成的僅一酮酸，可以直接或間接經 三羧酸循環氧化分解，同時釋放能量，是人體能量來源之一。但是，蛋白質的這種功能 可以由碳水化合物、脂肪所代替。因此，供給能量是蛋白質的次要功能。