首款!中國地方雞專用晶片「神農1號」研發成功!

河南農業大學 發佈 2024-03-15T01:16:31.119972+00:00

3月16日,我校康相濤教授團隊基於前期雞泛基因組研究成果與公共數據,開發了適用於我國地方雞基因組系列液相晶片——「神農1號」。

3月16日,我校康相濤教授團隊基於前期雞泛基因組研究成果與公共數據,開發了適用於我國地方雞基因組系列液相晶片——「神農1號」。該系列晶片的成功研發,搭建了用於地方雞種質資源鑑定、精準評價、保護與開發利用的高效技術平台,對我國家禽種業振興與可持續發展具有重要的意義。

該系列晶片採用模塊組合的設計思路:模塊I是利用66.5M泛基因組序列,設計5K標記;模塊II是整合生長、繁殖、屠體等性狀GWAS的功能位點,設計5K標記;模塊III是整合我國58個地方雞種中高頻SNP位點,設計30K標記;模塊IV是整合生長、羽色等性狀的原因InDel、SV、PAV突變位點。集成上述模塊,創製了40K、5K地方雞基因組系列晶片——「神農1號」。

團隊簡介

河南農業大學家禽團隊是教育部、農業部科研創新團隊。現有16名骨幹成員,其中教授9人、副教授3人。團隊帶頭人康相濤教授先後榮獲全國先進工作者、中華農業英才獎和首屆國際種業科學家獎等。團隊長期圍繞地方雞種質資源保護和利用開展研究,先後主持承擔國家「863」計劃、國家自然科學基金、神農種業實驗室「一流課題」項目等國家和省部級科研項目;主持培育國審新品種2個,完成的《中國地方雞種質資源優異性狀發掘創新與應用》獲國家技術發明獎二等獎、《地方雞保護利用技術體系創建與應用》獲國家科學技術進步獎二等獎,授權國家發明專利46項,制定國家和地方標準10項,發表中英文論文500餘篇。

上述研究成果的取得主要依託於神農種業實驗室、農業農村部畜禽資源(家禽)評價利用重點實驗室、河南省雞種質資源創新與利用重點實驗室、河南省家禽育種國際聯合實驗室和河南省家禽種質資源創新工程研究中心等省部級研究平台,以及保存了29個特色資源、設施設備一流的河南農業大學家禽種質資源場。

參考文獻

1.Wang K, Hu H, Tian Y, Li J, Scheben A, Zhang C, Li Y, Wu J, Yang L, Fan X, Sun G, Li D, Zhang Y, Han R, Jiang R, Huang H, Yan F, Wang Y, Li Z, Li G, Liu X, Li W, Edwards D, Kang X. The Chicken Pan-Genome Reveals Gene Content Variation and a Promoter Region Deletion in IGF2BP1 Affecting Body Size. Mol Biol Evol. 2021, 38(11):5066-5081.

2.https://omia.org/home/

3.Wang M, Thakur Mukesh, Peng M et al, 863 genomes reveal the origin and domestication of chicken. Cell Research, 2020, 30:693–701.

4.https://www.animalgenome.org/cgi-bin/QTLdb/GG/index


本期編輯:白家瑜

圖文來源:河南農業大學官方微信

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