鳳陽縣城東有一座約海拔約120米的饅頭狀山丘（被前些年採石搞得千瘡百孔），因其單獨凸起、無依無傍，故名「獨山」。
觀星台遺址就位於獨山之巔。 觀星台是明朝初年中都城觀測天文和氣象的機構，因屬欽天監管理，後人稱「欽天監觀星台」，簡稱觀星台。
獨山雖不是崇峰峻岭，卻也曾享有殊榮。朱元璋稱帝之初，在家鄉建中都城，因獨山距城較近，又是一個制高點，為都城防務計，特將獨山圍入中都城外垣（第三道城牆）之內，獨山東南二三百米，至今仍有一段中都城的土城牆與護城河遺址。
明洪武五年，於獨山頂設欽天監觀星台，以觀天文星象。據《鳳陽新書》記載，直到萬曆末年，觀星台尚有「璇璣、玉衡、銅盤等天文儀器列於松林之巔」。獨山西南，因地勢開闊平坦，又建東、西教武場，供禁軍在此演練武術陣法。清康熙年間，觀星台被拆毀後又有僧人建廟於山頂，四方信徒常前往敬香禮佛。每年三月二十日，廟內僧人在獨山舉行盛會，誦佛講經，以吸引八方香客。從那以後，獨山廟會每年都如期舉行，規模盛大，熱鬧非凡，一直沿襲至今，只是會址已改在城裡，且已變成「物資交流會」，後又城市建設、疫情防控等原因停辦。
2004年，國務院將「圜丘遺址、方丘遺址、觀星台遺址、塗山門遺址」作為明中都附屬建築，列入明中都皇故城的保護範圍。至此，觀星台遺址正式成為國家重點文物保護單位。