大凡臨床療效較好的醫家都是靈活地運用腧穴，合理配穴，而不是受某穴治某病的局限而墨守成方，呆板地配穴。雖然前人對於腧穴的功能及臨床應用積累了很多寶貴而豐富的經驗，但是如果我們不去研究腧穴的功能，不掌握腧穴的特性只是機械地照搬，死記某穴治某病，某病取某幾個穴，孤立地認識疾病，就會使我們在臨床上受到限制。特別是遇到複雜疑難病證往往會束手無策，即便是治療也是取穴不清，治療不明，病輕不知何因，病重不知何故。
賀老在臨證治療中，取穴方法非常靈活，一般以循經取穴為基礎，但絕不是簡單的頭痛醫頭，腳痛醫腳，而是嚴格按照經絡學說來辨證，分析疾病是屬於哪一經或哪幾經。
1.循經取穴
在眾多的穴位中，如何進行選穴是比較關鍵而又有一定難度的，賀老一般以循經取穴為基礎。要做到這一點，首先必須按照經絡學說來辨證，分析疾病是屬於哪一經或哪幾經。清代的《瓊瑤神書》中說「醫人針灸，不知何經受病，妄行取穴」是針灸療效不好的重要原因之一，因此針灸選穴的一個重要依據就是要按受病部位來分析病位在何經。對此早在《標幽賦》中就有「既論臟腑虛實，須向經尋」之說。明代張三錫在《經絡考》序中也指出：「臟腑陰陽，各有其經……明其部以定經，循其流以尋源，舍此而欲知病之所在，猶適燕而北行，豈不愈勞愈遠哉。」這實際也是強調針灸治病必須按病變部位來分析，才能順藤摸瓜，選出正確的穴位，真正做到「有的放矢」，這是循經取穴的基本原則。
2.隨症選穴
針對某一主要症狀取穴稱之為隨症選穴。關於隨症選穴我理解有兩方面的含義：一是根據疾病的病因病機來選取穴位，既要考慮病所與經絡的聯繫，又要根據經絡、臟腑的理論酌情選用針對病因的穴位，此時的選穴就要注重辨證取穴與辨經取穴相結合。二是根據疾病過程中出現的症狀來選取穴位。實際上針灸史上比較有代表性的對症取穴大多見於特定穴中，其中五輸穴最為突出，從賀老的治療中可以看出，相當多的穴位屬於特定穴的範疇，因此深入細緻地研究特定穴的應用對提高針灸療效是非常有意義的。
3.性能選穴
補氣：太淵、氣海、百會、膻中。
補血：血海、膈俞、中脘、絕骨。
滋陰：三陰交、陰郄、太溪、照海。
壯陽：命門、關元、太溪、腎俞。
舒肝：丘墟、太沖、內關、期門、蠡溝。
健脾：太白、建里、章門、脾俞。
解表：合谷、外關、大椎、（五輸）經穴。
祛風：風字穴位。
溫里：滎穴、壯陽穴。
通行穴：支溝、手三里、天樞、曲池、三焦俞、條口、環跳、歸來。
利水：太溪、四瀆、三陰交、陰陵泉、水分、水溝、水道。
祛痰：絡穴，邪隨絡穴而出。
鎮靜安神：神字穴。
升舉穴：百會、沖字穴，加補氣穴。
活血祛瘀：郄穴、局部放血、補血穴。
醒腦開竅：人中、井穴、四神聰、會陰、百會、內關。
退熱：大椎、膏肓俞、陰郄、勞宮、尺澤、耳尖放血、曲池、清冷淵。
治汗：合谷、復溜、陰郄、尺澤、氣海、勞宮。
扶正祛邪：原絡配穴。
4.部位選穴
半身：聽宮。
上半身：合谷。
下半身：太沖、環跳。
頭頂：太沖、湧泉、合谷。
頭兩側：足臨泣、外關、中渚。
枕部：至陰、後溪、長強。
前額：解溪、豐隆、合谷。
面部：合谷、沖陽、氣沖、條口。
眉棱骨：肝俞。
目：肝俞、臂臑、養老、光明、目窗、風池、行間。
鼻：通天、列缺、上星、孔最、肺俞、膻中。
口唇：脾俞、太白、豐隆。
牙齒：太溪、曲池、合谷、偏歷。
舌頭：通里、照海、風府、啞門、滑肉門。
耳朵：太溪、外關、懸鐘。
頸項：列缺、支正、崑崙。
咽喉：通里、照海。
肩：條口。
肘：沖陽。
手：大椎、中脘。
脊柱：後溪、人中、大鐘。
背：合谷、養老。
胸部：內關、足臨泣、梁丘、太淵、孔最、大陵。
乳房：足臨泣、梁丘、內關、肩井、少澤。
胃口：內庭。
脅部：丘墟透照海。
脅下：內關。
胃脘：足三里、梁丘、豐隆。
腹部：支溝、手三里、三陰交、足臨泣。
少腹：蠡溝。
腰部：委中、太溪、合陽。
前陰：大敦、水泉。
後陰：承山、二白。
大腿：腰陽關、秩邊、環跳。
腿部：風府、腰夾脊。
腳底：關元、氣海、命門、腎俞。
腳趾：百會、中脘、章門。
腋窩：內關、蠡溝。
5.病因選穴
外感：合谷、外關、大椎。
內傷：傷食：足三里、天樞。
外傷：局部放血、循經郄穴。
總之，選穴思路是多方面的，需要基礎全面，才能靈活運用。還可以考慮依據時間（子午流注）、體質、辨證、經驗、微刺系統、現代醫學認識等來選穴，根據上述思路，按君臣佐使組合成處方，才能更好地為臨床服務。
賀老認為，現在年輕中醫在臨床中存在的問題是穴位使用太多、不專，治療的重點不突出，所以臨床效果欠佳。另一方面重視文獻不夠，就如同木匠工具不齊全，是不可能做好手藝的。
他認為研究腧穴可以從五方面進行：①位置變異；②功能作用；③穴位的配伍；④針刺的深淺；⑤手法的不同。要取得好的療效，就必須全面考慮這五方面問題。
本文選自《中國百年百名中醫臨床家叢書•國醫大師卷：賀普仁》（中國中醫藥出版社出版，謝新才，等編著）