Nature:CRISPR篩選發現關鍵基因,讓抗腫瘤T細胞療法更強大、更持久

生物探索 發佈 2019-12-28T05:40:33+00:00

本文轉載自"BioWorld"。免疫療法方興未艾,並在腫瘤治療中展現出極佳的治療效果,而抗腫瘤T細胞療法是免疫療法的重要代表。細胞毒性CD8 T細胞可以直接殺死腫瘤細胞,是在臨床使用的許多免疫治療方法中動員的關鍵武器。

本文轉載自"BioWorld"。

免疫療法方興未艾,並在腫瘤治療中展現出極佳的治療效果,而抗腫瘤T細胞療法是免疫療法的重要代表。

細胞毒性CD8 T細胞可以直接殺死腫瘤細胞,是在臨床使用的許多免疫治療方法中動員的關鍵武器。然而,腫瘤組織能夠創造嚴酷的微環境,招募免疫調節細胞,並誘導抑制T細胞功能的信號分子的產生,從而阻礙了T細胞的功能、聚集和腫瘤浸潤。

這些研究表明抗腫瘤T細胞療法的療效會因為腫瘤組織的抵抗性反應而逐漸衰弱,那麼,我們該如何去規避這一現象的發生呢?

2019年12月11日,美國田納西州孟菲斯聖猶達兒童研究醫院遲洪波團隊在 Nature雜誌上發表了題為:Targeting REGNASE-1 programs long-lived effector T cells for cancer therapy(以REGNASE-1為靶點的重編程長壽命效應T細胞用於癌症治療)的研究論文。

論文研究發現,REGNASE-1蛋白的缺失延長了抗腫瘤CD8 T細胞的存活,增強了它們的功能,使T細胞能夠更好地、更有效地與癌症作鬥爭。

免疫細胞抗腫瘤療法深刻地改善了對某些惡性腫瘤的治療,最常見的便是過繼性T細胞治療(ACT)。這種方法依賴於從人的血液或腫瘤中取出的T細胞,在實驗室進行刺激以誘導分裂分化甚至修改細胞表面受體,使其轉化為抗腫瘤T細胞,再回輸到病人體內,從而殺傷患者體內的腫瘤細胞。例如,CAR-T療法,在T細胞上表達一種專門針對腫瘤細胞的受體——嵌合抗原受體(CAR-T),這一療法在治療白血病等血液腫瘤上是非常成功的。

儘管免疫細胞療法具有巨大的潛力,但目前ACT的治療效用是有限的,因為回輸到患者體內的改良T細胞往往僅能短暫存在,而且常常無法克服腫瘤組織的抵抗性作用。正常情況下,機體內抵抗了病原體或腫瘤細胞後,會留下一類被稱為記憶T細胞長壽命細胞,它們是自我更新的,如果再次遇到相同的感染或惡性腫瘤,它們可以迅速增殖產生大量的細胞毒性CD8 T細胞。然而,如果不能消除感染或腫瘤,細胞毒性T細胞將逐漸失去其功能(稱為exhaustion的過程)。

用於ACT的理想T細胞群能夠浸潤腫瘤並大量積累,同時保留細胞毒性功能和自我更新能力。但T細胞分化為細胞毒性CD8T細胞損害了成功保留了形成長期記憶細胞的潛力。研究者於是提出了這樣一個問題:是否有一種策略可以在ACT的T細胞中誘導出這兩種有益的性狀。

研究表明,在複雜的腫瘤微環境中,CD8 T細胞需要有強烈的新陳代謝,以維持生存所需的營養和能量需求,從而保持其抗腫瘤活性。

於是該團隊等利用CRISPR/Cas9文庫篩選技術敲除了3000多個與T細胞代謝相關的基因,在小鼠抗腫瘤ACT模型中對這些基因的功能進行了檢測。研究團隊鑑定了200多個基因,這些基因可以顯著影響轉移到荷瘤小鼠體內的CD8 T細胞的持久性和功能。許多基因的破壞會對細胞的存活能力產生負面影響,從而在腫瘤中積累,但有4個基因的破壞會導致更多的T細胞浸潤腫瘤組織。

這4個基因中作用最顯著的是編碼REGNASE-1酶的基因,該酶與RNA結合併降解RNA,從而影響免疫應答,但其在CD8 T細胞抗腫瘤作用中的作用尚未見報導。REGNASE-1缺失的CD8 T細胞在腫瘤組織中的積累量是正常CD8 T細胞的2000倍。缺乏REGNASE-1的CD8 T細胞比野生型CD8 T細胞能更好地對抗兩種腫瘤——黑色素瘤和急性淋巴細胞白血病。

為了更好地理解REGNASE-1缺失導致T細胞在腫瘤組織中持續性增加的原因,作者分析了REGNASE-1缺陷型細胞和野生型細胞的基因表達譜。REGNASE-1的缺失與記憶T細胞分子特徵的增加有關,表明存在比正常群體更大的長壽命記憶樣細胞,這些細胞可快速增殖產生細胞毒性CD8 T細胞。

Regase-1缺失的CD8T細胞表現為線粒體功能顯著增加(線粒體是提供細胞能量的關鍵來源的細胞器),包括產生能量和消耗氧氣的能力。這是十分值得注意的,因為這種能力在抗腫瘤T細胞中經常受到損害。

REGNASE-1缺陷的這些聯合效應若能應用於ACT的CD8 T細胞和CAR-T細胞,那麼便能使ACT免疫療法產生質的飛躍——重編程T細胞在靶向的癌症中積累並隨時間保持活性。

為了進一步了解這一機制,研究團隊使用CRISPR/Cas9敲除文庫來破壞REGNASE-1缺陷的CD8 T細胞中的大約20000個基因,以查明介導REGNASE-1依賴性細胞重編程的關鍵下游基因。

轉錄因子BATF是CD8 T細胞分化的關鍵調控因子,它的失活使缺乏REGNASE-1的T細胞的長壽命和與線粒體相關的高表達基因不復存在。作者發現,REGNASE-1與PTPN2或SOCS1兩種蛋白的聯合缺失具有協同效應,與僅缺失REGNASE-1的T細胞的特性相比,更能增加T細胞的持久性、積累量和抗腫瘤活性。

研究團隊報導了REGNASE-1缺失的腫瘤記憶樣細胞和細胞毒性CD8 T細胞中,其細胞毒性蛋白的表達均高於野生型CD8 T細胞。具有記憶性質的野生型細胞一般不會直接殺死腫瘤細胞,而REGNASE-1缺失記憶樣T細胞是否僅具有自我更新和增殖產生細胞毒性CD8-T細胞群的功能,或是否也能直接介導腫瘤細胞殺傷尚不清楚。

如果REGNASE-1缺失的記憶樣T細胞擁有殺傷腫瘤細胞的能力,那麼它又是如何保持自身活性的呢?更有趣的是,研究者表示,REGNASE-1缺失的CD8 T細胞需要遇到特異性識別的腫瘤抗原才能持續保持活性。這可能解釋了為什麼抗腫瘤T細胞相比於富含T細胞難以接觸到腫瘤抗原的脾臟組織,更顯著地在小鼠腫瘤組織中的聚集。

腫瘤微環境中的其他因素是否有助於增強REGNASE-1缺失CD8 T細胞的持久性仍有待研究。為此,對REGNASE-1、PTPN2、SOCS1和BATF組合性缺失的CD8 T細胞的代謝特徵進行評估可能具有極好的參考價值。

這將有助於我們了解這些蛋白對CD8T細胞代謝重編程的影響,以及這對細胞分化和抗腫瘤功能的重要性。此外,在這種情況下找到相關的代謝物可能會為這些CD8 T細胞如何受到營養缺失的腫瘤微環境的影響提供線索。

這項研究為ACT免疫療法的發展提供了重要的理論依據。十分值得去嘗試在CAR-T細胞的製造過程中,利用CD8 T細胞來刪除或表達低水平的REGNASE-1基因,並觀察其可行性。

最後,鑒於腫瘤細胞中PTPN2的抑制使其對免疫治療更具敏感性,那麼我們是否可以在ACT免疫療法中以REGNASE-1 CD8 T細胞和PTPN2抑制劑進行聯合治療,從而使腫瘤免疫治療的療效更強大、更持久。

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參考資料:

[1] https://doi.org/10.1038/s41586-019-1821-z

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