零號病人「杜加」可以甩鍋了,HIV病毒出現時間又向前推進(轉載)

張德禮教授清北博士後 發佈 2020-06-11T17:34:20+00:00

零號病人「杜加」可以甩鍋了,HIV病毒出現時間又向前推進了(轉載)健康時尚之旅 06-10 22:13近期發表在《美國國家科學院院刊》(PNAS )上一項研究中,科學家給出了HIV病毒的迄今最古老基因序列(近乎完整),這些序列從1966年在剛果民主共和國採集並保存的血液樣本中獲得

零號病人「杜加」可以甩鍋了,HIV病毒出現時間又向前推進了(轉載)

健康時尚之旅 06-10 22:13

近期發表在《美國國家科學院院刊》(PNAS )上一項研究中,科學家給出了HIV病毒的迄今最古老基因序列(近乎完整),這些序列從1966年在剛果民主共和國採集並保存的血液樣本中獲得。

此前獲得的HIV最老病毒序列也來自於剛果民主共和國於1976年採集並保存的血液樣本。此次進展,使時間點又向前至少推進了10年。(註:人類首次明確由愛滋病病毒導致人類患愛滋病的時間是1983年。)

像這樣的「史前」基因序列有助於查明HIV病毒發生基因突變的時間,進而幫助科學家追蹤其傳播歷史以及擴散到人類中的時間點。


這項新研究的作者之一、比利時魯汶大學的博士後研究員索菲•格里瑟爾(Sophie Gryseels)主攻進化和計算病毒學研究。她表示,這個序列很符合研究人員先前對HIV出現時間的理解。

嘗試填補HIV病毒進化路上的拼圖

科學家們基於新發現的基因序列,認為HIV最早於1900年代初期從黑猩猩跳轉到非州中部人群,並站穩了腳跟。它有多種毒株,其中的HIV-1型M組亞型占全球病例總數的95%。自HIV病毒開始全球擴散,已有超過3200萬人死於愛滋病。

從HIV-1型毒株開始在人類群體中傳播,到人類真正發現它,中間至少隔了80年。 愛滋病毒的許多早期動態仍然是神秘的 ,而病毒突變率的數學模型有望給出更多關於病毒何時開始人際傳播的線索,不過有一個關鍵問題橫亘在前面:


HIV-1的M組亞型毒株於何時,以及為什麼,能製造95%的感染者,能如此高效地擴散全球?

要計算出這個問題對於病毒突變率計算模型來說目前仍有難度。因為在格里瑟爾看來,雖然此類模型近些年表現出色,但在分析更長時間段里的事件變得不那麼可靠, 部分原因在於遺傳信息會隨著時間流逝而丟失

因此,發現一種舊毒株有點像古生物學家發現始祖鳥。這是一塊重要拼圖,有助於填補進化線路上的缺失片段。

20世紀50年代前,HIV就在人群中傳播

格里瑟爾加入了一項正由亞利桑那大學進化生物學家麥可•沃羅貝(Michael Worobey)領銜的項目,並與來自比利時、美國和剛果民主共和國的同事一起分析了1958—1966年在中非收集的1645個活檢組織標本。


活檢標本先用福馬林固定,然後又被包埋在石蠟中。他們使用高靈敏度PCR方法(類似用於檢測鼻咽拭子中SARS-CoV-2的方法),尋找HIV基因組的線索。

他們在一位38歲男子淋巴結活檢組織里發現了病毒相關基因序列:其中一個來自1959年,另一個則是1960年的。但這些片段並不完整,因此無法提供有關病毒突變的太多信息。

格里瑟爾表示, 這些片段來自不同亞型的毒株,表明病毒於1950年代之前已經在人類中傳播了一段時間

她接著說道:「研究人員將繼續在早期的組織樣本中尋找年代更久的HIV基因組。理想的情況是在更多樣本來確認結果。」

下一個目標是弄清楚HIV-1何時加速全球流行的腳步。

尋找加速HIV傳播的因素

HIV-1基因組的某些變化可能是它加速的原因之一,但社會變化或許更為關鍵。

1900年代初期,非洲中部城市化進程加快。

1910—1950年代,公共衛生運動給昏睡病、瘧疾和梅毒這些惡疾的治療帶來了福音,但其中很多治療在進行過程中並未對針頭作恰當的消毒處理,給HIV病毒的大面積擴散提供了有利條件。

1960年代的非殖民化運動也很可能促進了病毒傳播。


格里瑟爾說道:「如果我們對那個擴散實際發生的時間點有了更深入可靠的判斷,就可以更穩當地確定到底是哪波運動或哪次事件是愛滋病遍布全球的最大嫌疑幫助犯。」


資料來源:

Oldest 'nearly complete' HIV genome found in forgotten tissue sample from 1966

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