2個團隊體外合成新冠病毒:能在一周內生產或改造出大量病毒活體

愛科學愛自然 發佈 2020-05-05T22:46:10+00:00

無需從病人體內分離病毒,直接使用酵母快速生產出大量有活性的新型冠狀病毒,這一技術可對突然爆發的病毒疫情快速做出反應,可以在爆發期間實時生成不斷發展的RNA病毒變體並對其功能進行表征,大大減少因病毒變異給研究帶來的帶來的困難。

由於新病例的迅速增加,2019年冠狀病毒病(COVID-19)很快引起了全球關注,病原體被鑑定為SARS-CoV-2。截至目前(4月30日),據約翰·霍普金斯大學發布的實時統計數據,全球累計新冠肺炎確診病例超過323萬例,死亡人數達22萬。這些數字每天都會更新,而且預計還會進一步增加。但是,對於全球能快速的合成及改造病毒的能力,不是很清楚。

2020年5月4日,瑞士伯爾尼大學Jorerg JoresVolker Thiel團隊在Nature 上發表了題為"Rapid reconstruction of SARS-CoV-2 using a synthetic genomics platform" 的研究論文,該研究展示了基於酵母的合成基因組學平台的完整功能,能夠在合成基因片段後一周內,對新型冠狀病毒(SARS-CoV-2)進行工程改造和復活。無需從病人體內分離病毒,直接使用酵母快速生產出大量有活性的新型冠狀病毒(SARS-CoV-2),這一技術可對突然爆發的病毒疫情快速做出反應,可以在爆發期間實時生成不斷發展的RNA病毒變體並對其功能進行表征,大大減少因病毒變異給研究帶來的帶來的困難

另外,2020年4月4日,德克薩斯大學醫學院師培勇等團隊在Cell Host & Microbe 在線發表題為「An infectious cDNA clone of SARS-CoV-2」的研究論文,該研究報告了SARS-CoV-2的反向遺傳合成策略。將跨越SARS-CoV-2基因組的七個cDNA片段組裝成一個全基因組cDNA。在體外將cDNA轉錄成為有感染性的病毒RNA,通過電穿孔將RNA導入後,進入細胞後具有高度感染性,產生2.9×10^6 PFU / ml病毒體。與臨床分離株相比,克隆來源的SARS-CoV-2(icSARS-CoV 2)表現出相似的噬菌斑形態,病毒RNA譜和複製動力學。此外,icSARS-CoV-2保留了工程分子標記,並且未獲得其他突變。通過將這種報告基因導入病毒基因組的OFR7中,可以生成穩定的mNeonGreen SARS-CoV-2(icSARS-CoV-2-mNG)。icSARSCoV-2-mNG已成功用於評估干擾素的抗病毒活性。


總的來說,這2項研究開發的新系統,突破了病毒來源的限制,能夠在短時間內(一周)大量生產或改造活性病毒,以用於疾病診斷、動物模型建立、中間宿主確認、疫苗研發等研究。



由於新病例的迅速增加,2019年冠狀病毒病(COVID-19)很快引起了全球關注,病原體被鑑定為SARS-CoV-2。截至目前(4月30日),據約翰·霍普金斯大學發布的實時統計數據,全球累計新冠肺炎確診病例超過323萬例,死亡人數達22萬。這些數字每天都會更新,而且預計還會進一步增加。


冠狀病毒(CoVs)是迄今為止被鑑定出的最大的RNA病毒,冠狀病毒科分為4個屬,分別為α,β,δ和γ冠狀病毒,而β冠狀病毒又分為A,B ,C和D譜系。可以感染人類的七種冠狀病毒(HCoV)包括α冠狀病毒中的HCoV-229E和HCoV-NL63,β冠狀病毒譜系A中的HCoV-OC43和HCoV-HKU1,β-冠狀病毒譜系B中的SARS-CoV和SARS-CoV-2;β-冠狀病毒譜系C中的MERS-CoV


該研究展示了基於酵母的合成基因組學平台的完整功能,能夠在合成基因片段後一周內,對新型冠狀病毒(SARS-CoV-2)進行工程改造和復活。無需從病人體內分離病毒,直接使用酵母快速生產出大量有活性的新型冠狀病毒(SARS-CoV-2),這一技術可對突然爆發的病毒疫情快速做出反應,可以在爆發期間實時生成不斷發展的RNA病毒變體並對其功能進行表征,大大減少因病毒變異給研究帶來的帶來的困難


另外,2020年4月4日,德克薩斯大學醫學院師培勇等團隊在Cell Host & Microbe 在線發表題為「An infectious cDNA clone of SARS-CoV-2」的研究論文,該研究報告了SARS-CoV-2的反向遺傳合成策略。將跨越SARS-CoV-2基因組的七個cDNA片段組裝成一個全基因組cDNA。在體外將cDNA轉錄成為有感染性的病毒RNA,通過電穿孔將RNA導入後,進入細胞後具有高度感染性,產生2.9×10^6 PFU / ml病毒體。


mNeonGreen病毒的穩定性和應用


與臨床分離株相比,克隆來源的SARS-CoV-2(icSARS-CoV 2)表現出相似的噬菌斑形態,病毒RNA譜和複製動力學。此外,icSARS-CoV-2保留了工程分子標記,並且未獲得其他突變。通過將這種報告基因導入病毒基因組的OFR7中,可以生成穩定的mNeonGreen SARS-CoV-2(icSARS-CoV-2-mNG)。icSARSCoV-2-mNG已成功用於評估干擾素的抗病毒活性。


全長SARS-CoV-2感染cDNA克隆的裝配


總的來說,這2項研究開發的新系統,突破了病毒來源的限制,能夠在短時間內(一周)大量生產或改造活性病毒,以用於疾病診斷、動物模型建立、中間宿主確認、疫苗研發等研究。


參考消息:


https://marlin-prod.literatumonline.com/pb-assets/products/coronavirus/CHOM_2291_s50_preproof.pdf

https://www.nature.com/articles/s41586-020-2294-9


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