如果哺乳期急性腸胃炎臨床症狀不明顯，可以先觀察，暫時不用任何藥物，也可以正常哺乳。但飲食要清淡，最好是軟溫的食物，少食多餐更好，還要保證食物的安全性，以免加重急性腸胃炎。如果急性胃腸炎臨床症狀明顯，如腹瀉、噁心、嘔吐、腹痛等，應暫停母乳餵養，可用奶粉代替，並積極治療。
急性期治療
補液是急性期最重要的治療，補液的方法、數量和速度應根據脫水程度而定。輕度脫水患者可口服補液鹽，重度脫水患者需靜脈補液。情況好轉後，可採用口服補液，遵醫囑補充鉀、鈣、鋅。
藥物治療
1.腸黏膜保護劑和吸附劑:常見的蒙脫石散可吸附腸內毒素，保護胃黏膜，急性腹瀉可縮短腹瀉病程，減少腹瀉次數。
2.益生菌製劑:由布拉氏酵母菌、鼠李糖乳桿菌、雙歧桿菌等腸道益生菌組成的特殊活性微生物製劑。對病毒感染引起的水樣腹瀉有明顯療效，但對侵襲性細菌引起的腹瀉無明顯療效。
3.抗菌藥物:常用的抗生素為氟喹諾酮類，對大多數細菌性急性胃腸炎均有較好的療效。但是，孕婦和哺乳期婦女需要告知醫生，避免使用對胎兒有明顯毒性的藥物。他們可以選擇青黴素、三代頭孢如頭孢曲松等對胎兒和孕婦影響不大的藥物。
4.止瀉藥:洛哌丁胺為常用藥，可抑制腸道蠕動，緩解腹瀉，但對發熱或明顯腹痛等感染引起的炎症性腹瀉和血性腹瀉患者及兒童禁用。
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